Protein–RNA interactions for Protein: Q70JA7

CHSY3, Chondroitin sulfate synthase 3, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHSY3Q70JA7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHSY3Q70JA7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHSY3Q70JA7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHSY3Q70JA7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHSY3Q70JA7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHSY3Q70JA7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHSY3Q70JA7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHSY3Q70JA7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHSY3Q70JA7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHSY3Q70JA7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHSY3Q70JA7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHSY3Q70JA7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHSY3Q70JA7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHSY3Q70JA7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHSY3Q70JA7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHSY3Q70JA7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHSY3Q70JA7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHSY3Q70JA7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHSY3Q70JA7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHSY3Q70JA7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHSY3Q70JA7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHSY3Q70JA7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHSY3Q70JA7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHSY3Q70JA7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHSY3Q70JA7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHSY3Q70JA7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHSY3Q70JA7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHSY3Q70JA7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHSY3Q70JA7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHSY3Q70JA7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHSY3Q70JA7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHSY3Q70JA7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHSY3Q70JA7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHSY3Q70JA7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHSY3Q70JA7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHSY3Q70JA7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHSY3Q70JA7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CHSY3Q70JA7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHSY3Q70JA7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHSY3Q70JA7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHSY3Q70JA7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHSY3Q70JA7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CHSY3Q70JA7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHSY3Q70JA7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHSY3Q70JA7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHSY3Q70JA7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHSY3Q70JA7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CHSY3Q70JA7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHSY3Q70JA7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHSY3Q70JA7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHSY3Q70JA7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHSY3Q70JA7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHSY3Q70JA7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHSY3Q70JA7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHSY3Q70JA7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHSY3Q70JA7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHSY3Q70JA7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHSY3Q70JA7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHSY3Q70JA7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHSY3Q70JA7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHSY3Q70JA7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CHSY3Q70JA7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHSY3Q70JA7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHSY3Q70JA7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHSY3Q70JA7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHSY3Q70JA7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHSY3Q70JA7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHSY3Q70JA7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHSY3Q70JA7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHSY3Q70JA7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CHSY3Q70JA7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHSY3Q70JA7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHSY3Q70JA7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHSY3Q70JA7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHSY3Q70JA7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHSY3Q70JA7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHSY3Q70JA7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHSY3Q70JA7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHSY3Q70JA7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHSY3Q70JA7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHSY3Q70JA7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHSY3Q70JA7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHSY3Q70JA7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHSY3Q70JA7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHSY3Q70JA7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHSY3Q70JA7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHSY3Q70JA7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHSY3Q70JA7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHSY3Q70JA7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHSY3Q70JA7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHSY3Q70JA7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHSY3Q70JA7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHSY3Q70JA7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHSY3Q70JA7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHSY3Q70JA7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHSY3Q70JA7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CHSY3Q70JA7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHSY3Q70JA7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHSY3Q70JA7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHSY3Q70JA7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms