Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM72Q6ZMU5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM72Q6ZMU5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM72Q6ZMU5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM72Q6ZMU5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM72Q6ZMU5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM72Q6ZMU5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM72Q6ZMU5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM72Q6ZMU5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM72Q6ZMU5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM72Q6ZMU5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM72Q6ZMU5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM72Q6ZMU5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM72Q6ZMU5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM72Q6ZMU5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM72Q6ZMU5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM72Q6ZMU5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM72Q6ZMU5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM72Q6ZMU5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM72Q6ZMU5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM72Q6ZMU5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM72Q6ZMU5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM72Q6ZMU5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM72Q6ZMU5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM72Q6ZMU5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM72Q6ZMU5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM72Q6ZMU5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM72Q6ZMU5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM72Q6ZMU5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM72Q6ZMU5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM72Q6ZMU5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM72Q6ZMU5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM72Q6ZMU5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM72Q6ZMU5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM72Q6ZMU5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM72Q6ZMU5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM72Q6ZMU5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM72Q6ZMU5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM72Q6ZMU5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM72Q6ZMU5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRIM72Q6ZMU5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM72Q6ZMU5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM72Q6ZMU5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM72Q6ZMU5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM72Q6ZMU5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM72Q6ZMU5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM72Q6ZMU5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM72Q6ZMU5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM72Q6ZMU5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM72Q6ZMU5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM72Q6ZMU5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM72Q6ZMU5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM72Q6ZMU5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM72Q6ZMU5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM72Q6ZMU5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM72Q6ZMU5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM72Q6ZMU5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM72Q6ZMU5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM72Q6ZMU5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM72Q6ZMU5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM72Q6ZMU5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM72Q6ZMU5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM72Q6ZMU5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM72Q6ZMU5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM72Q6ZMU5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM72Q6ZMU5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM72Q6ZMU5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM72Q6ZMU5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM72Q6ZMU5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM72Q6ZMU5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM72Q6ZMU5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM72Q6ZMU5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM72Q6ZMU5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM72Q6ZMU5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TRIM72Q6ZMU5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TRIM72Q6ZMU5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM72Q6ZMU5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM72Q6ZMU5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM72Q6ZMU5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM72Q6ZMU5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM72Q6ZMU5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM72Q6ZMU5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM72Q6ZMU5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM72Q6ZMU5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM72Q6ZMU5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM72Q6ZMU5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM72Q6ZMU5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM72Q6ZMU5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM72Q6ZMU5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM72Q6ZMU5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM72Q6ZMU5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM72Q6ZMU5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM72Q6ZMU5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM72Q6ZMU5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM72Q6ZMU5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM72Q6ZMU5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM72Q6ZMU5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM72Q6ZMU5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM72Q6ZMU5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM72Q6ZMU5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms