Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWJ1

TMCO3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3Q6UWJ1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMCO3Q6UWJ1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMCO3Q6UWJ1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMCO3Q6UWJ1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMCO3Q6UWJ1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMCO3Q6UWJ1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMCO3Q6UWJ1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMCO3Q6UWJ1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMCO3Q6UWJ1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMCO3Q6UWJ1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TMCO3Q6UWJ1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMCO3Q6UWJ1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMCO3Q6UWJ1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMCO3Q6UWJ1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMCO3Q6UWJ1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMCO3Q6UWJ1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMCO3Q6UWJ1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMCO3Q6UWJ1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMCO3Q6UWJ1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMCO3Q6UWJ1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMCO3Q6UWJ1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMCO3Q6UWJ1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMCO3Q6UWJ1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMCO3Q6UWJ1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMCO3Q6UWJ1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMCO3Q6UWJ1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMCO3Q6UWJ1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMCO3Q6UWJ1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMCO3Q6UWJ1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMCO3Q6UWJ1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TMCO3Q6UWJ1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMCO3Q6UWJ1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMCO3Q6UWJ1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMCO3Q6UWJ1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMCO3Q6UWJ1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMCO3Q6UWJ1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMCO3Q6UWJ1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMCO3Q6UWJ1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMCO3Q6UWJ1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMCO3Q6UWJ1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMCO3Q6UWJ1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TMCO3Q6UWJ1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMCO3Q6UWJ1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMCO3Q6UWJ1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMCO3Q6UWJ1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMCO3Q6UWJ1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMCO3Q6UWJ1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMCO3Q6UWJ1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMCO3Q6UWJ1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMCO3Q6UWJ1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMCO3Q6UWJ1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMCO3Q6UWJ1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMCO3Q6UWJ1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMCO3Q6UWJ1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMCO3Q6UWJ1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMCO3Q6UWJ1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMCO3Q6UWJ1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMCO3Q6UWJ1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMCO3Q6UWJ1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMCO3Q6UWJ1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMCO3Q6UWJ1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMCO3Q6UWJ1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMCO3Q6UWJ1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMCO3Q6UWJ1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMCO3Q6UWJ1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMCO3Q6UWJ1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMCO3Q6UWJ1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMCO3Q6UWJ1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMCO3Q6UWJ1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMCO3Q6UWJ1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMCO3Q6UWJ1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMCO3Q6UWJ1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMCO3Q6UWJ1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMCO3Q6UWJ1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMCO3Q6UWJ1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TMCO3Q6UWJ1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMCO3Q6UWJ1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TMCO3Q6UWJ1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMCO3Q6UWJ1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMCO3Q6UWJ1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMCO3Q6UWJ1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMCO3Q6UWJ1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TMCO3Q6UWJ1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TMCO3Q6UWJ1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TMCO3Q6UWJ1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
TMCO3Q6UWJ1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMCO3Q6UWJ1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMCO3Q6UWJ1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMCO3Q6UWJ1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMCO3Q6UWJ1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMCO3Q6UWJ1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMCO3Q6UWJ1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMCO3Q6UWJ1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMCO3Q6UWJ1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMCO3Q6UWJ1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMCO3Q6UWJ1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMCO3Q6UWJ1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMCO3Q6UWJ1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMCO3Q6UWJ1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMCO3Q6UWJ1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms