Protein–RNA interactions for Protein: Q6SZW1

SARM1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARM1Q6SZW1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SARM1Q6SZW1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SARM1Q6SZW1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SARM1Q6SZW1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SARM1Q6SZW1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SARM1Q6SZW1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SARM1Q6SZW1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SARM1Q6SZW1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SARM1Q6SZW1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SARM1Q6SZW1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SARM1Q6SZW1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SARM1Q6SZW1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SARM1Q6SZW1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SARM1Q6SZW1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SARM1Q6SZW1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SARM1Q6SZW1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SARM1Q6SZW1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SARM1Q6SZW1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SARM1Q6SZW1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SARM1Q6SZW1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SARM1Q6SZW1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SARM1Q6SZW1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SARM1Q6SZW1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SARM1Q6SZW1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SARM1Q6SZW1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SARM1Q6SZW1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SARM1Q6SZW1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SARM1Q6SZW1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SARM1Q6SZW1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SARM1Q6SZW1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SARM1Q6SZW1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SARM1Q6SZW1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SARM1Q6SZW1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SARM1Q6SZW1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SARM1Q6SZW1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SARM1Q6SZW1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SARM1Q6SZW1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SARM1Q6SZW1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SARM1Q6SZW1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SARM1Q6SZW1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SARM1Q6SZW1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SARM1Q6SZW1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SARM1Q6SZW1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SARM1Q6SZW1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SARM1Q6SZW1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SARM1Q6SZW1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SARM1Q6SZW1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SARM1Q6SZW1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SARM1Q6SZW1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SARM1Q6SZW1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SARM1Q6SZW1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SARM1Q6SZW1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SARM1Q6SZW1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SARM1Q6SZW1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SARM1Q6SZW1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SARM1Q6SZW1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SARM1Q6SZW1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SARM1Q6SZW1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SARM1Q6SZW1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SARM1Q6SZW1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SARM1Q6SZW1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SARM1Q6SZW1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SARM1Q6SZW1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SARM1Q6SZW1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SARM1Q6SZW1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SARM1Q6SZW1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SARM1Q6SZW1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SARM1Q6SZW1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SARM1Q6SZW1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SARM1Q6SZW1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SARM1Q6SZW1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SARM1Q6SZW1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SARM1Q6SZW1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SARM1Q6SZW1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SARM1Q6SZW1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SARM1Q6SZW1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SARM1Q6SZW1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SARM1Q6SZW1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SARM1Q6SZW1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SARM1Q6SZW1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SARM1Q6SZW1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SARM1Q6SZW1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SARM1Q6SZW1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SARM1Q6SZW1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SARM1Q6SZW1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SARM1Q6SZW1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SARM1Q6SZW1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SARM1Q6SZW1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SARM1Q6SZW1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SARM1Q6SZW1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SARM1Q6SZW1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SARM1Q6SZW1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SARM1Q6SZW1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SARM1Q6SZW1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SARM1Q6SZW1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SARM1Q6SZW1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SARM1Q6SZW1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SARM1Q6SZW1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SARM1Q6SZW1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SARM1Q6SZW1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms