Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q6P435 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q6P435 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q6P435 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q6P435 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q6P435 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q6P435 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q6P435 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q6P435 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q6P435 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q6P435 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q6P435 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q6P435 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q6P435 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q6P435 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q6P435 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q6P435 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q6P435 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q6P435 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q6P435 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q6P435 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q6P435 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q6P435 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q6P435 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q6P435 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q6P435 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Q6P435 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Q6P435 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q6P435 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q6P435 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q6P435 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q6P435 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q6P435 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q6P435 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q6P435 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Q6P435 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Q6P435 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Q6P435 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Q6P435 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Q6P435 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Q6P435 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q6P435 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q6P435 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Q6P435 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q6P435 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q6P435 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q6P435 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q6P435 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q6P435 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q6P435 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q6P435 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q6P435 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q6P435 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q6P435 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q6P435 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q6P435 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q6P435 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q6P435 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q6P435 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q6P435 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q6P435 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q6P435 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q6P435 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q6P435 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q6P435 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q6P435 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q6P435 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q6P435 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q6P435 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Q6P435 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q6P435 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q6P435 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q6P435 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q6P435 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q6P435 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q6P435 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Q6P435 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Q6P435 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Q6P435 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Q6P435 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Q6P435 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Q6P435 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Q6P435 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Q6P435 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Q6P435 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Q6P435 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Q6P435 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Q6P435 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Q6P435 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Q6P435 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Q6P435 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Q6P435 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Q6P435 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Q6P435 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Q6P435 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Q6P435 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Q6P435 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Q6P435 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Q6P435 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Q6P435 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms