Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRNP1Q6NT89 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRNP1Q6NT89 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRNP1Q6NT89 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRNP1Q6NT89 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TRNP1Q6NT89 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRNP1Q6NT89 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRNP1Q6NT89 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TRNP1Q6NT89 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRNP1Q6NT89 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRNP1Q6NT89 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRNP1Q6NT89 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TRNP1Q6NT89 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TRNP1Q6NT89 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRNP1Q6NT89 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRNP1Q6NT89 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRNP1Q6NT89 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRNP1Q6NT89 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRNP1Q6NT89 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRNP1Q6NT89 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRNP1Q6NT89 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRNP1Q6NT89 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRNP1Q6NT89 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRNP1Q6NT89 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRNP1Q6NT89 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRNP1Q6NT89 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRNP1Q6NT89 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRNP1Q6NT89 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRNP1Q6NT89 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRNP1Q6NT89 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRNP1Q6NT89 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRNP1Q6NT89 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRNP1Q6NT89 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TRNP1Q6NT89 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRNP1Q6NT89 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRNP1Q6NT89 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRNP1Q6NT89 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRNP1Q6NT89 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRNP1Q6NT89 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRNP1Q6NT89 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRNP1Q6NT89 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRNP1Q6NT89 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRNP1Q6NT89 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TRNP1Q6NT89 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRNP1Q6NT89 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRNP1Q6NT89 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRNP1Q6NT89 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRNP1Q6NT89 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRNP1Q6NT89 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRNP1Q6NT89 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRNP1Q6NT89 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRNP1Q6NT89 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRNP1Q6NT89 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRNP1Q6NT89 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRNP1Q6NT89 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRNP1Q6NT89 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRNP1Q6NT89 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRNP1Q6NT89 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRNP1Q6NT89 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TRNP1Q6NT89 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRNP1Q6NT89 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRNP1Q6NT89 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TRNP1Q6NT89 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRNP1Q6NT89 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRNP1Q6NT89 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRNP1Q6NT89 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRNP1Q6NT89 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRNP1Q6NT89 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRNP1Q6NT89 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRNP1Q6NT89 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRNP1Q6NT89 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRNP1Q6NT89 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRNP1Q6NT89 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRNP1Q6NT89 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRNP1Q6NT89 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRNP1Q6NT89 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TRNP1Q6NT89 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRNP1Q6NT89 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRNP1Q6NT89 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TRNP1Q6NT89 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRNP1Q6NT89 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRNP1Q6NT89 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRNP1Q6NT89 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRNP1Q6NT89 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRNP1Q6NT89 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRNP1Q6NT89 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRNP1Q6NT89 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRNP1Q6NT89 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRNP1Q6NT89 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRNP1Q6NT89 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRNP1Q6NT89 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRNP1Q6NT89 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRNP1Q6NT89 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRNP1Q6NT89 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TRNP1Q6NT89 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRNP1Q6NT89 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRNP1Q6NT89 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRNP1Q6NT89 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRNP1Q6NT89 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRNP1Q6NT89 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms