Protein–RNA interactions for Protein: Q6MZZ7

CAPN13, Calpain-13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN13Q6MZZ7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN13Q6MZZ7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN13Q6MZZ7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN13Q6MZZ7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPN13Q6MZZ7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPN13Q6MZZ7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPN13Q6MZZ7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPN13Q6MZZ7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPN13Q6MZZ7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPN13Q6MZZ7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPN13Q6MZZ7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPN13Q6MZZ7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN13Q6MZZ7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN13Q6MZZ7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN13Q6MZZ7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN13Q6MZZ7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN13Q6MZZ7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN13Q6MZZ7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN13Q6MZZ7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN13Q6MZZ7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN13Q6MZZ7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN13Q6MZZ7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN13Q6MZZ7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN13Q6MZZ7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN13Q6MZZ7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN13Q6MZZ7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN13Q6MZZ7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN13Q6MZZ7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN13Q6MZZ7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN13Q6MZZ7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN13Q6MZZ7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN13Q6MZZ7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN13Q6MZZ7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN13Q6MZZ7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN13Q6MZZ7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN13Q6MZZ7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN13Q6MZZ7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN13Q6MZZ7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN13Q6MZZ7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN13Q6MZZ7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN13Q6MZZ7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN13Q6MZZ7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN13Q6MZZ7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN13Q6MZZ7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN13Q6MZZ7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN13Q6MZZ7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN13Q6MZZ7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN13Q6MZZ7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN13Q6MZZ7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN13Q6MZZ7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN13Q6MZZ7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN13Q6MZZ7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN13Q6MZZ7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN13Q6MZZ7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN13Q6MZZ7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN13Q6MZZ7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN13Q6MZZ7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN13Q6MZZ7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN13Q6MZZ7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN13Q6MZZ7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN13Q6MZZ7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN13Q6MZZ7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN13Q6MZZ7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN13Q6MZZ7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN13Q6MZZ7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN13Q6MZZ7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN13Q6MZZ7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN13Q6MZZ7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN13Q6MZZ7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN13Q6MZZ7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN13Q6MZZ7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN13Q6MZZ7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN13Q6MZZ7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN13Q6MZZ7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN13Q6MZZ7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN13Q6MZZ7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN13Q6MZZ7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN13Q6MZZ7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN13Q6MZZ7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN13Q6MZZ7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN13Q6MZZ7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPN13Q6MZZ7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPN13Q6MZZ7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPN13Q6MZZ7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPN13Q6MZZ7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPN13Q6MZZ7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPN13Q6MZZ7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPN13Q6MZZ7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN13Q6MZZ7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN13Q6MZZ7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN13Q6MZZ7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN13Q6MZZ7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN13Q6MZZ7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN13Q6MZZ7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN13Q6MZZ7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN13Q6MZZ7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN13Q6MZZ7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN13Q6MZZ7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN13Q6MZZ7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN13Q6MZZ7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms