Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RCSD1Q6JBY9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RCSD1Q6JBY9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RCSD1Q6JBY9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RCSD1Q6JBY9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RCSD1Q6JBY9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RCSD1Q6JBY9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RCSD1Q6JBY9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RCSD1Q6JBY9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
RCSD1Q6JBY9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RCSD1Q6JBY9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RCSD1Q6JBY9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RCSD1Q6JBY9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
RCSD1Q6JBY9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RCSD1Q6JBY9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RCSD1Q6JBY9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RCSD1Q6JBY9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RCSD1Q6JBY9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RCSD1Q6JBY9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RCSD1Q6JBY9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RCSD1Q6JBY9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RCSD1Q6JBY9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
RCSD1Q6JBY9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RCSD1Q6JBY9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RCSD1Q6JBY9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RCSD1Q6JBY9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RCSD1Q6JBY9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RCSD1Q6JBY9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RCSD1Q6JBY9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
RCSD1Q6JBY9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RCSD1Q6JBY9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RCSD1Q6JBY9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RCSD1Q6JBY9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RCSD1Q6JBY9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RCSD1Q6JBY9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RCSD1Q6JBY9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RCSD1Q6JBY9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RCSD1Q6JBY9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RCSD1Q6JBY9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RCSD1Q6JBY9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RCSD1Q6JBY9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RCSD1Q6JBY9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RCSD1Q6JBY9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RCSD1Q6JBY9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RCSD1Q6JBY9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RCSD1Q6JBY9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RCSD1Q6JBY9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RCSD1Q6JBY9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RCSD1Q6JBY9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
RCSD1Q6JBY9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RCSD1Q6JBY9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
RCSD1Q6JBY9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RCSD1Q6JBY9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RCSD1Q6JBY9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RCSD1Q6JBY9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RCSD1Q6JBY9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RCSD1Q6JBY9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
RCSD1Q6JBY9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RCSD1Q6JBY9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RCSD1Q6JBY9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RCSD1Q6JBY9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RCSD1Q6JBY9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RCSD1Q6JBY9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RCSD1Q6JBY9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RCSD1Q6JBY9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RCSD1Q6JBY9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RCSD1Q6JBY9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RCSD1Q6JBY9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RCSD1Q6JBY9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RCSD1Q6JBY9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RCSD1Q6JBY9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RCSD1Q6JBY9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RCSD1Q6JBY9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RCSD1Q6JBY9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RCSD1Q6JBY9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RCSD1Q6JBY9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RCSD1Q6JBY9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RCSD1Q6JBY9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RCSD1Q6JBY9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RCSD1Q6JBY9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RCSD1Q6JBY9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RCSD1Q6JBY9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RCSD1Q6JBY9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RCSD1Q6JBY9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RCSD1Q6JBY9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
RCSD1Q6JBY9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RCSD1Q6JBY9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RCSD1Q6JBY9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RCSD1Q6JBY9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RCSD1Q6JBY9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RCSD1Q6JBY9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RCSD1Q6JBY9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RCSD1Q6JBY9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RCSD1Q6JBY9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
RCSD1Q6JBY9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RCSD1Q6JBY9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RCSD1Q6JBY9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RCSD1Q6JBY9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RCSD1Q6JBY9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RCSD1Q6JBY9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms