Protein–RNA interactions for Protein: Q6EKJ0

GTF2IRD2B, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2IRD2BQ6EKJ0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2IRD2BQ6EKJ0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2IRD2BQ6EKJ0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2IRD2BQ6EKJ0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2IRD2BQ6EKJ0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GTF2IRD2BQ6EKJ0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GTF2IRD2BQ6EKJ0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2IRD2BQ6EKJ0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2IRD2BQ6EKJ0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2IRD2BQ6EKJ0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2IRD2BQ6EKJ0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2IRD2BQ6EKJ0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2IRD2BQ6EKJ0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2IRD2BQ6EKJ0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2IRD2BQ6EKJ0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2IRD2BQ6EKJ0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2IRD2BQ6EKJ0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2IRD2BQ6EKJ0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2IRD2BQ6EKJ0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2IRD2BQ6EKJ0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2IRD2BQ6EKJ0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2IRD2BQ6EKJ0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2IRD2BQ6EKJ0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2IRD2BQ6EKJ0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2IRD2BQ6EKJ0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2IRD2BQ6EKJ0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2IRD2BQ6EKJ0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2IRD2BQ6EKJ0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2IRD2BQ6EKJ0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2IRD2BQ6EKJ0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2IRD2BQ6EKJ0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2IRD2BQ6EKJ0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2IRD2BQ6EKJ0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2IRD2BQ6EKJ0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2IRD2BQ6EKJ0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2IRD2BQ6EKJ0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2IRD2BQ6EKJ0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms