Protein–RNA interactions for Protein: Q6AZZ1

TRIM68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM68Q6AZZ1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM68Q6AZZ1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM68Q6AZZ1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM68Q6AZZ1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM68Q6AZZ1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM68Q6AZZ1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM68Q6AZZ1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM68Q6AZZ1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM68Q6AZZ1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM68Q6AZZ1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM68Q6AZZ1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM68Q6AZZ1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM68Q6AZZ1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM68Q6AZZ1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM68Q6AZZ1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM68Q6AZZ1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM68Q6AZZ1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM68Q6AZZ1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM68Q6AZZ1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM68Q6AZZ1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM68Q6AZZ1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM68Q6AZZ1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM68Q6AZZ1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM68Q6AZZ1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRIM68Q6AZZ1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM68Q6AZZ1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM68Q6AZZ1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM68Q6AZZ1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM68Q6AZZ1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM68Q6AZZ1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM68Q6AZZ1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM68Q6AZZ1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM68Q6AZZ1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM68Q6AZZ1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM68Q6AZZ1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM68Q6AZZ1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM68Q6AZZ1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM68Q6AZZ1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM68Q6AZZ1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM68Q6AZZ1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM68Q6AZZ1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM68Q6AZZ1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM68Q6AZZ1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM68Q6AZZ1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM68Q6AZZ1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM68Q6AZZ1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM68Q6AZZ1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM68Q6AZZ1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM68Q6AZZ1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM68Q6AZZ1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM68Q6AZZ1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM68Q6AZZ1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM68Q6AZZ1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRIM68Q6AZZ1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM68Q6AZZ1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM68Q6AZZ1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM68Q6AZZ1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM68Q6AZZ1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM68Q6AZZ1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM68Q6AZZ1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM68Q6AZZ1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM68Q6AZZ1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM68Q6AZZ1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM68Q6AZZ1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM68Q6AZZ1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM68Q6AZZ1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM68Q6AZZ1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM68Q6AZZ1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM68Q6AZZ1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM68Q6AZZ1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM68Q6AZZ1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM68Q6AZZ1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM68Q6AZZ1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM68Q6AZZ1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM68Q6AZZ1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM68Q6AZZ1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM68Q6AZZ1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM68Q6AZZ1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM68Q6AZZ1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM68Q6AZZ1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM68Q6AZZ1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM68Q6AZZ1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM68Q6AZZ1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM68Q6AZZ1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM68Q6AZZ1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM68Q6AZZ1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM68Q6AZZ1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM68Q6AZZ1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM68Q6AZZ1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM68Q6AZZ1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM68Q6AZZ1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM68Q6AZZ1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM68Q6AZZ1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM68Q6AZZ1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM68Q6AZZ1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM68Q6AZZ1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM68Q6AZZ1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM68Q6AZZ1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM68Q6AZZ1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM68Q6AZZ1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms