Protein–RNA interactions for Protein: Q5YKI7

GGNBP1, Putative gametogenetin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGNBP1Q5YKI7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GGNBP1Q5YKI7 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GGNBP1Q5YKI7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GGNBP1Q5YKI7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GGNBP1Q5YKI7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GGNBP1Q5YKI7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GGNBP1Q5YKI7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GGNBP1Q5YKI7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GGNBP1Q5YKI7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GGNBP1Q5YKI7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GGNBP1Q5YKI7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GGNBP1Q5YKI7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GGNBP1Q5YKI7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GGNBP1Q5YKI7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GGNBP1Q5YKI7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GGNBP1Q5YKI7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GGNBP1Q5YKI7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GGNBP1Q5YKI7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GGNBP1Q5YKI7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GGNBP1Q5YKI7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GGNBP1Q5YKI7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GGNBP1Q5YKI7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GGNBP1Q5YKI7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GGNBP1Q5YKI7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GGNBP1Q5YKI7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GGNBP1Q5YKI7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GGNBP1Q5YKI7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GGNBP1Q5YKI7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GGNBP1Q5YKI7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GGNBP1Q5YKI7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GGNBP1Q5YKI7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GGNBP1Q5YKI7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GGNBP1Q5YKI7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GGNBP1Q5YKI7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GGNBP1Q5YKI7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GGNBP1Q5YKI7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GGNBP1Q5YKI7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GGNBP1Q5YKI7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GGNBP1Q5YKI7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GGNBP1Q5YKI7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GGNBP1Q5YKI7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
GGNBP1Q5YKI7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GGNBP1Q5YKI7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
GGNBP1Q5YKI7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GGNBP1Q5YKI7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GGNBP1Q5YKI7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GGNBP1Q5YKI7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GGNBP1Q5YKI7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GGNBP1Q5YKI7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GGNBP1Q5YKI7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GGNBP1Q5YKI7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GGNBP1Q5YKI7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GGNBP1Q5YKI7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GGNBP1Q5YKI7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GGNBP1Q5YKI7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GGNBP1Q5YKI7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GGNBP1Q5YKI7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GGNBP1Q5YKI7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GGNBP1Q5YKI7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GGNBP1Q5YKI7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GGNBP1Q5YKI7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
GGNBP1Q5YKI7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GGNBP1Q5YKI7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GGNBP1Q5YKI7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GGNBP1Q5YKI7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GGNBP1Q5YKI7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GGNBP1Q5YKI7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GGNBP1Q5YKI7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GGNBP1Q5YKI7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GGNBP1Q5YKI7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
GGNBP1Q5YKI7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GGNBP1Q5YKI7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GGNBP1Q5YKI7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GGNBP1Q5YKI7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GGNBP1Q5YKI7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GGNBP1Q5YKI7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GGNBP1Q5YKI7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GGNBP1Q5YKI7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GGNBP1Q5YKI7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GGNBP1Q5YKI7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
GGNBP1Q5YKI7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GGNBP1Q5YKI7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GGNBP1Q5YKI7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GGNBP1Q5YKI7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GGNBP1Q5YKI7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GGNBP1Q5YKI7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GGNBP1Q5YKI7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GGNBP1Q5YKI7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GGNBP1Q5YKI7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GGNBP1Q5YKI7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GGNBP1Q5YKI7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GGNBP1Q5YKI7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GGNBP1Q5YKI7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GGNBP1Q5YKI7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GGNBP1Q5YKI7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GGNBP1Q5YKI7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GGNBP1Q5YKI7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GGNBP1Q5YKI7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GGNBP1Q5YKI7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
GGNBP1Q5YKI7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms