Protein–RNA interactions for Protein: Q5Y7H0

HLA-DQA1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQA1Q5Y7H0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-DQA1Q5Y7H0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-DQA1Q5Y7H0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-DQA1Q5Y7H0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-DQA1Q5Y7H0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-DQA1Q5Y7H0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-DQA1Q5Y7H0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-DQA1Q5Y7H0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-DQA1Q5Y7H0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-DQA1Q5Y7H0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-DQA1Q5Y7H0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-DQA1Q5Y7H0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-DQA1Q5Y7H0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-DQA1Q5Y7H0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-DQA1Q5Y7H0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-DQA1Q5Y7H0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-DQA1Q5Y7H0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-DQA1Q5Y7H0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-DQA1Q5Y7H0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-DQA1Q5Y7H0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-DQA1Q5Y7H0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-DQA1Q5Y7H0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-DQA1Q5Y7H0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-DQA1Q5Y7H0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-DQA1Q5Y7H0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-DQA1Q5Y7H0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-DQA1Q5Y7H0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-DQA1Q5Y7H0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-DQA1Q5Y7H0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-DQA1Q5Y7H0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-DQA1Q5Y7H0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-DQA1Q5Y7H0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-DQA1Q5Y7H0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-DQA1Q5Y7H0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-DQA1Q5Y7H0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-DQA1Q5Y7H0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-DQA1Q5Y7H0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-DQA1Q5Y7H0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-DQA1Q5Y7H0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-DQA1Q5Y7H0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-DQA1Q5Y7H0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-DQA1Q5Y7H0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-DQA1Q5Y7H0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-DQA1Q5Y7H0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-DQA1Q5Y7H0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-DQA1Q5Y7H0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-DQA1Q5Y7H0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-DQA1Q5Y7H0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-DQA1Q5Y7H0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-DQA1Q5Y7H0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-DQA1Q5Y7H0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-DQA1Q5Y7H0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-DQA1Q5Y7H0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-DQA1Q5Y7H0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-DQA1Q5Y7H0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-DQA1Q5Y7H0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-DQA1Q5Y7H0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-DQA1Q5Y7H0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLA-DQA1Q5Y7H0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLA-DQA1Q5Y7H0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLA-DQA1Q5Y7H0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLA-DQA1Q5Y7H0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLA-DQA1Q5Y7H0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLA-DQA1Q5Y7H0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-DQA1Q5Y7H0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-DQA1Q5Y7H0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-DQA1Q5Y7H0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-DQA1Q5Y7H0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-DQA1Q5Y7H0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HLA-DQA1Q5Y7H0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HLA-DQA1Q5Y7H0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HLA-DQA1Q5Y7H0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HLA-DQA1Q5Y7H0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HLA-DQA1Q5Y7H0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HLA-DQA1Q5Y7H0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HLA-DQA1Q5Y7H0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLA-DQA1Q5Y7H0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLA-DQA1Q5Y7H0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLA-DQA1Q5Y7H0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLA-DQA1Q5Y7H0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HLA-DQA1Q5Y7H0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLA-DQA1Q5Y7H0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLA-DQA1Q5Y7H0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLA-DQA1Q5Y7H0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLA-DQA1Q5Y7H0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLA-DQA1Q5Y7H0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLA-DQA1Q5Y7H0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLA-DQA1Q5Y7H0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLA-DQA1Q5Y7H0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLA-DQA1Q5Y7H0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLA-DQA1Q5Y7H0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLA-DQA1Q5Y7H0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLA-DQA1Q5Y7H0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLA-DQA1Q5Y7H0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HLA-DQA1Q5Y7H0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLA-DQA1Q5Y7H0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLA-DQA1Q5Y7H0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HLA-DQA1Q5Y7H0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-DQA1Q5Y7H0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-DQA1Q5Y7H0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms