Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU9

C9orf84, Uncharacterized protein C9orf84, humanhuman

Predictions only

Length 1,444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf84Q5VXU9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
C9orf84Q5VXU9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
C9orf84Q5VXU9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
C9orf84Q5VXU9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
C9orf84Q5VXU9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
C9orf84Q5VXU9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
C9orf84Q5VXU9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
C9orf84Q5VXU9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
C9orf84Q5VXU9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
C9orf84Q5VXU9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC36.36■■■■□ 3.41
C9orf84Q5VXU9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
C9orf84Q5VXU9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC36.36■■■■□ 3.41
C9orf84Q5VXU9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
C9orf84Q5VXU9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
C9orf84Q5VXU9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
C9orf84Q5VXU9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
C9orf84Q5VXU9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
C9orf84Q5VXU9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
C9orf84Q5VXU9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
C9orf84Q5VXU9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
C9orf84Q5VXU9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
C9orf84Q5VXU9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
C9orf84Q5VXU9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
C9orf84Q5VXU9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
C9orf84Q5VXU9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
C9orf84Q5VXU9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
C9orf84Q5VXU9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC36.33■■■■□ 3.41
C9orf84Q5VXU9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
C9orf84Q5VXU9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
C9orf84Q5VXU9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
C9orf84Q5VXU9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
C9orf84Q5VXU9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
C9orf84Q5VXU9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
C9orf84Q5VXU9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
C9orf84Q5VXU9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
C9orf84Q5VXU9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
C9orf84Q5VXU9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
C9orf84Q5VXU9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
C9orf84Q5VXU9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
C9orf84Q5VXU9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
C9orf84Q5VXU9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
C9orf84Q5VXU9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC36.29■■■■□ 3.4
C9orf84Q5VXU9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
C9orf84Q5VXU9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
C9orf84Q5VXU9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
C9orf84Q5VXU9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
C9orf84Q5VXU9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
C9orf84Q5VXU9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
C9orf84Q5VXU9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
C9orf84Q5VXU9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
C9orf84Q5VXU9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
C9orf84Q5VXU9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
C9orf84Q5VXU9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
C9orf84Q5VXU9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
C9orf84Q5VXU9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
C9orf84Q5VXU9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
C9orf84Q5VXU9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.4
C9orf84Q5VXU9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
C9orf84Q5VXU9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
C9orf84Q5VXU9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
C9orf84Q5VXU9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
C9orf84Q5VXU9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
C9orf84Q5VXU9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
C9orf84Q5VXU9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
C9orf84Q5VXU9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
C9orf84Q5VXU9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
C9orf84Q5VXU9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
C9orf84Q5VXU9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
C9orf84Q5VXU9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
C9orf84Q5VXU9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
C9orf84Q5VXU9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC36.22■■■■□ 3.39
C9orf84Q5VXU9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC36.22■■■■□ 3.39
C9orf84Q5VXU9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
C9orf84Q5VXU9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
C9orf84Q5VXU9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
C9orf84Q5VXU9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
C9orf84Q5VXU9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
C9orf84Q5VXU9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
C9orf84Q5VXU9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
C9orf84Q5VXU9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
C9orf84Q5VXU9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.38
C9orf84Q5VXU9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
C9orf84Q5VXU9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
C9orf84Q5VXU9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
C9orf84Q5VXU9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
C9orf84Q5VXU9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
C9orf84Q5VXU9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
C9orf84Q5VXU9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
C9orf84Q5VXU9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
C9orf84Q5VXU9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
C9orf84Q5VXU9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
C9orf84Q5VXU9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
C9orf84Q5VXU9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
C9orf84Q5VXU9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
C9orf84Q5VXU9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
C9orf84Q5VXU9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
C9orf84Q5VXU9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
C9orf84Q5VXU9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
C9orf84Q5VXU9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
C9orf84Q5VXU9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms