Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD13Q5VXD3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD13Q5VXD3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD13Q5VXD3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAMD13Q5VXD3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAMD13Q5VXD3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAMD13Q5VXD3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAMD13Q5VXD3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAMD13Q5VXD3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAMD13Q5VXD3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAMD13Q5VXD3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAMD13Q5VXD3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAMD13Q5VXD3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAMD13Q5VXD3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAMD13Q5VXD3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SAMD13Q5VXD3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SAMD13Q5VXD3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SAMD13Q5VXD3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SAMD13Q5VXD3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SAMD13Q5VXD3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SAMD13Q5VXD3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SAMD13Q5VXD3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SAMD13Q5VXD3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SAMD13Q5VXD3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SAMD13Q5VXD3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SAMD13Q5VXD3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SAMD13Q5VXD3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SAMD13Q5VXD3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SAMD13Q5VXD3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SAMD13Q5VXD3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SAMD13Q5VXD3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SAMD13Q5VXD3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SAMD13Q5VXD3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SAMD13Q5VXD3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SAMD13Q5VXD3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SAMD13Q5VXD3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SAMD13Q5VXD3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SAMD13Q5VXD3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SAMD13Q5VXD3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SAMD13Q5VXD3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SAMD13Q5VXD3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SAMD13Q5VXD3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SAMD13Q5VXD3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SAMD13Q5VXD3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SAMD13Q5VXD3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SAMD13Q5VXD3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SAMD13Q5VXD3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SAMD13Q5VXD3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SAMD13Q5VXD3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SAMD13Q5VXD3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SAMD13Q5VXD3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SAMD13Q5VXD3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SAMD13Q5VXD3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SAMD13Q5VXD3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SAMD13Q5VXD3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SAMD13Q5VXD3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SAMD13Q5VXD3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SAMD13Q5VXD3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SAMD13Q5VXD3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SAMD13Q5VXD3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SAMD13Q5VXD3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SAMD13Q5VXD3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SAMD13Q5VXD3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SAMD13Q5VXD3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SAMD13Q5VXD3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SAMD13Q5VXD3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SAMD13Q5VXD3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SAMD13Q5VXD3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SAMD13Q5VXD3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAMD13Q5VXD3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAMD13Q5VXD3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAMD13Q5VXD3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SAMD13Q5VXD3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAMD13Q5VXD3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAMD13Q5VXD3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAMD13Q5VXD3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAMD13Q5VXD3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAMD13Q5VXD3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SAMD13Q5VXD3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAMD13Q5VXD3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAMD13Q5VXD3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAMD13Q5VXD3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAMD13Q5VXD3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SAMD13Q5VXD3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SAMD13Q5VXD3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SAMD13Q5VXD3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SAMD13Q5VXD3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SAMD13Q5VXD3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SAMD13Q5VXD3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SAMD13Q5VXD3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SAMD13Q5VXD3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SAMD13Q5VXD3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SAMD13Q5VXD3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SAMD13Q5VXD3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SAMD13Q5VXD3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SAMD13Q5VXD3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SAMD13Q5VXD3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SAMD13Q5VXD3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SAMD13Q5VXD3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SAMD13Q5VXD3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms