Protein–RNA interactions for Protein: Q5TZA2

CROCC, Rootletin, humanhuman

Predictions only

Length 2,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROCCQ5TZA2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CROCCQ5TZA2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CROCCQ5TZA2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CROCCQ5TZA2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CROCCQ5TZA2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CROCCQ5TZA2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CROCCQ5TZA2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CROCCQ5TZA2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CROCCQ5TZA2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CROCCQ5TZA2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CROCCQ5TZA2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CROCCQ5TZA2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CROCCQ5TZA2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CROCCQ5TZA2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CROCCQ5TZA2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CROCCQ5TZA2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CROCCQ5TZA2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CROCCQ5TZA2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CROCCQ5TZA2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CROCCQ5TZA2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CROCCQ5TZA2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CROCCQ5TZA2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CROCCQ5TZA2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CROCCQ5TZA2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CROCCQ5TZA2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CROCCQ5TZA2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CROCCQ5TZA2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CROCCQ5TZA2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CROCCQ5TZA2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CROCCQ5TZA2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CROCCQ5TZA2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CROCCQ5TZA2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CROCCQ5TZA2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CROCCQ5TZA2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CROCCQ5TZA2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CROCCQ5TZA2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CROCCQ5TZA2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CROCCQ5TZA2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CROCCQ5TZA2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CROCCQ5TZA2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CROCCQ5TZA2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CROCCQ5TZA2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CROCCQ5TZA2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CROCCQ5TZA2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CROCCQ5TZA2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CROCCQ5TZA2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CROCCQ5TZA2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CROCCQ5TZA2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CROCCQ5TZA2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CROCCQ5TZA2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CROCCQ5TZA2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CROCCQ5TZA2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CROCCQ5TZA2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CROCCQ5TZA2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CROCCQ5TZA2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CROCCQ5TZA2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CROCCQ5TZA2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CROCCQ5TZA2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CROCCQ5TZA2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CROCCQ5TZA2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CROCCQ5TZA2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CROCCQ5TZA2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CROCCQ5TZA2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CROCCQ5TZA2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CROCCQ5TZA2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CROCCQ5TZA2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CROCCQ5TZA2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CROCCQ5TZA2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CROCCQ5TZA2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CROCCQ5TZA2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CROCCQ5TZA2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CROCCQ5TZA2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CROCCQ5TZA2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CROCCQ5TZA2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CROCCQ5TZA2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CROCCQ5TZA2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CROCCQ5TZA2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CROCCQ5TZA2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CROCCQ5TZA2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CROCCQ5TZA2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CROCCQ5TZA2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CROCCQ5TZA2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CROCCQ5TZA2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CROCCQ5TZA2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CROCCQ5TZA2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CROCCQ5TZA2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CROCCQ5TZA2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CROCCQ5TZA2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CROCCQ5TZA2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CROCCQ5TZA2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CROCCQ5TZA2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CROCCQ5TZA2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CROCCQ5TZA2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CROCCQ5TZA2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CROCCQ5TZA2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CROCCQ5TZA2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CROCCQ5TZA2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CROCCQ5TZA2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CROCCQ5TZA2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CROCCQ5TZA2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94 ms