Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P8

SYT6, Synaptotagmin-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6Q5T7P8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYT6Q5T7P8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYT6Q5T7P8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYT6Q5T7P8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYT6Q5T7P8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYT6Q5T7P8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYT6Q5T7P8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYT6Q5T7P8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYT6Q5T7P8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYT6Q5T7P8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYT6Q5T7P8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYT6Q5T7P8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SYT6Q5T7P8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYT6Q5T7P8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYT6Q5T7P8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SYT6Q5T7P8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYT6Q5T7P8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYT6Q5T7P8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYT6Q5T7P8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYT6Q5T7P8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYT6Q5T7P8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SYT6Q5T7P8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SYT6Q5T7P8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SYT6Q5T7P8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SYT6Q5T7P8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SYT6Q5T7P8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYT6Q5T7P8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYT6Q5T7P8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYT6Q5T7P8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYT6Q5T7P8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SYT6Q5T7P8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYT6Q5T7P8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYT6Q5T7P8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SYT6Q5T7P8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYT6Q5T7P8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SYT6Q5T7P8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SYT6Q5T7P8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SYT6Q5T7P8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYT6Q5T7P8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYT6Q5T7P8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYT6Q5T7P8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYT6Q5T7P8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SYT6Q5T7P8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SYT6Q5T7P8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYT6Q5T7P8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SYT6Q5T7P8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SYT6Q5T7P8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYT6Q5T7P8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SYT6Q5T7P8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SYT6Q5T7P8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYT6Q5T7P8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SYT6Q5T7P8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SYT6Q5T7P8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SYT6Q5T7P8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYT6Q5T7P8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYT6Q5T7P8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SYT6Q5T7P8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYT6Q5T7P8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SYT6Q5T7P8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYT6Q5T7P8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SYT6Q5T7P8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYT6Q5T7P8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SYT6Q5T7P8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYT6Q5T7P8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SYT6Q5T7P8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT6Q5T7P8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT6Q5T7P8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT6Q5T7P8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT6Q5T7P8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT6Q5T7P8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT6Q5T7P8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT6Q5T7P8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT6Q5T7P8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT6Q5T7P8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT6Q5T7P8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT6Q5T7P8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYT6Q5T7P8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYT6Q5T7P8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYT6Q5T7P8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYT6Q5T7P8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYT6Q5T7P8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYT6Q5T7P8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYT6Q5T7P8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYT6Q5T7P8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYT6Q5T7P8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYT6Q5T7P8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYT6Q5T7P8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYT6Q5T7P8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYT6Q5T7P8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYT6Q5T7P8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYT6Q5T7P8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT6Q5T7P8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT6Q5T7P8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT6Q5T7P8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT6Q5T7P8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT6Q5T7P8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT6Q5T7P8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT6Q5T7P8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT6Q5T7P8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT6Q5T7P8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.1 ms