Protein–RNA interactions for Protein: Q5RKV6

EXOSC6, Exosome complex component MTR3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC6Q5RKV6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXOSC6Q5RKV6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXOSC6Q5RKV6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXOSC6Q5RKV6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXOSC6Q5RKV6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXOSC6Q5RKV6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXOSC6Q5RKV6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXOSC6Q5RKV6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXOSC6Q5RKV6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXOSC6Q5RKV6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXOSC6Q5RKV6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXOSC6Q5RKV6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXOSC6Q5RKV6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXOSC6Q5RKV6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXOSC6Q5RKV6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXOSC6Q5RKV6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
EXOSC6Q5RKV6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOSC6Q5RKV6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOSC6Q5RKV6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOSC6Q5RKV6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOSC6Q5RKV6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOSC6Q5RKV6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXOSC6Q5RKV6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXOSC6Q5RKV6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXOSC6Q5RKV6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXOSC6Q5RKV6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXOSC6Q5RKV6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXOSC6Q5RKV6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXOSC6Q5RKV6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
EXOSC6Q5RKV6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXOSC6Q5RKV6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXOSC6Q5RKV6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXOSC6Q5RKV6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXOSC6Q5RKV6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXOSC6Q5RKV6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EXOSC6Q5RKV6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EXOSC6Q5RKV6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EXOSC6Q5RKV6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EXOSC6Q5RKV6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EXOSC6Q5RKV6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EXOSC6Q5RKV6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EXOSC6Q5RKV6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EXOSC6Q5RKV6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXOSC6Q5RKV6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXOSC6Q5RKV6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXOSC6Q5RKV6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXOSC6Q5RKV6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXOSC6Q5RKV6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXOSC6Q5RKV6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXOSC6Q5RKV6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXOSC6Q5RKV6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXOSC6Q5RKV6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXOSC6Q5RKV6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXOSC6Q5RKV6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXOSC6Q5RKV6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXOSC6Q5RKV6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXOSC6Q5RKV6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXOSC6Q5RKV6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXOSC6Q5RKV6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
EXOSC6Q5RKV6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
EXOSC6Q5RKV6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
EXOSC6Q5RKV6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
EXOSC6Q5RKV6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXOSC6Q5RKV6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXOSC6Q5RKV6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXOSC6Q5RKV6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXOSC6Q5RKV6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXOSC6Q5RKV6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXOSC6Q5RKV6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
EXOSC6Q5RKV6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXOSC6Q5RKV6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXOSC6Q5RKV6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXOSC6Q5RKV6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
EXOSC6Q5RKV6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXOSC6Q5RKV6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXOSC6Q5RKV6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
EXOSC6Q5RKV6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
EXOSC6Q5RKV6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EXOSC6Q5RKV6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EXOSC6Q5RKV6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EXOSC6Q5RKV6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EXOSC6Q5RKV6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EXOSC6Q5RKV6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EXOSC6Q5RKV6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EXOSC6Q5RKV6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXOSC6Q5RKV6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXOSC6Q5RKV6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
EXOSC6Q5RKV6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
EXOSC6Q5RKV6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
EXOSC6Q5RKV6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXOSC6Q5RKV6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXOSC6Q5RKV6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EXOSC6Q5RKV6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EXOSC6Q5RKV6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EXOSC6Q5RKV6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EXOSC6Q5RKV6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EXOSC6Q5RKV6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EXOSC6Q5RKV6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EXOSC6Q5RKV6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
EXOSC6Q5RKV6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms