Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD39Q53RE8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD39Q53RE8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD39Q53RE8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD39Q53RE8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD39Q53RE8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD39Q53RE8 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD39Q53RE8 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD39Q53RE8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD39Q53RE8 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD39Q53RE8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD39Q53RE8 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD39Q53RE8 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD39Q53RE8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD39Q53RE8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD39Q53RE8 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD39Q53RE8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD39Q53RE8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD39Q53RE8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD39Q53RE8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD39Q53RE8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD39Q53RE8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD39Q53RE8 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD39Q53RE8 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ANKRD39Q53RE8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ANKRD39Q53RE8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ANKRD39Q53RE8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ANKRD39Q53RE8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ANKRD39Q53RE8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ANKRD39Q53RE8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD39Q53RE8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD39Q53RE8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD39Q53RE8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD39Q53RE8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD39Q53RE8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD39Q53RE8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD39Q53RE8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD39Q53RE8 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD39Q53RE8 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD39Q53RE8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD39Q53RE8 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD39Q53RE8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD39Q53RE8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD39Q53RE8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD39Q53RE8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD39Q53RE8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD39Q53RE8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD39Q53RE8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD39Q53RE8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD39Q53RE8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD39Q53RE8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD39Q53RE8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD39Q53RE8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD39Q53RE8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD39Q53RE8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD39Q53RE8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD39Q53RE8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD39Q53RE8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD39Q53RE8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD39Q53RE8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD39Q53RE8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD39Q53RE8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD39Q53RE8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD39Q53RE8 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD39Q53RE8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD39Q53RE8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD39Q53RE8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD39Q53RE8 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD39Q53RE8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD39Q53RE8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD39Q53RE8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD39Q53RE8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD39Q53RE8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD39Q53RE8 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD39Q53RE8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD39Q53RE8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD39Q53RE8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD39Q53RE8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD39Q53RE8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD39Q53RE8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD39Q53RE8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD39Q53RE8 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD39Q53RE8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD39Q53RE8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD39Q53RE8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD39Q53RE8 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD39Q53RE8 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ANKRD39Q53RE8 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ANKRD39Q53RE8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ANKRD39Q53RE8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
ANKRD39Q53RE8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ANKRD39Q53RE8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD39Q53RE8 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD39Q53RE8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD39Q53RE8 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD39Q53RE8 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD39Q53RE8 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD39Q53RE8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD39Q53RE8 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ANKRD39Q53RE8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms