Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
C4orf46Q504U0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C4orf46Q504U0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C4orf46Q504U0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C4orf46Q504U0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C4orf46Q504U0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C4orf46Q504U0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C4orf46Q504U0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C4orf46Q504U0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C4orf46Q504U0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C4orf46Q504U0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C4orf46Q504U0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C4orf46Q504U0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C4orf46Q504U0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C4orf46Q504U0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
C4orf46Q504U0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
C4orf46Q504U0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
C4orf46Q504U0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
C4orf46Q504U0 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
C4orf46Q504U0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C4orf46Q504U0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
C4orf46Q504U0 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C4orf46Q504U0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C4orf46Q504U0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C4orf46Q504U0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C4orf46Q504U0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C4orf46Q504U0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C4orf46Q504U0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C4orf46Q504U0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C4orf46Q504U0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C4orf46Q504U0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C4orf46Q504U0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C4orf46Q504U0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C4orf46Q504U0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C4orf46Q504U0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C4orf46Q504U0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C4orf46Q504U0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C4orf46Q504U0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C4orf46Q504U0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C4orf46Q504U0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C4orf46Q504U0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C4orf46Q504U0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C4orf46Q504U0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C4orf46Q504U0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C4orf46Q504U0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C4orf46Q504U0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C4orf46Q504U0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C4orf46Q504U0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C4orf46Q504U0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C4orf46Q504U0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C4orf46Q504U0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C4orf46Q504U0 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C4orf46Q504U0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C4orf46Q504U0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C4orf46Q504U0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C4orf46Q504U0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C4orf46Q504U0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C4orf46Q504U0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C4orf46Q504U0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
C4orf46Q504U0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C4orf46Q504U0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
C4orf46Q504U0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
C4orf46Q504U0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
C4orf46Q504U0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C4orf46Q504U0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
C4orf46Q504U0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C4orf46Q504U0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C4orf46Q504U0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C4orf46Q504U0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C4orf46Q504U0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
C4orf46Q504U0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
C4orf46Q504U0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
C4orf46Q504U0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
C4orf46Q504U0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
C4orf46Q504U0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
C4orf46Q504U0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
C4orf46Q504U0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
C4orf46Q504U0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
C4orf46Q504U0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C4orf46Q504U0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C4orf46Q504U0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
C4orf46Q504U0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
C4orf46Q504U0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
C4orf46Q504U0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
C4orf46Q504U0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
C4orf46Q504U0 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
C4orf46Q504U0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
C4orf46Q504U0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
C4orf46Q504U0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
C4orf46Q504U0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
C4orf46Q504U0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
C4orf46Q504U0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
C4orf46Q504U0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
C4orf46Q504U0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
C4orf46Q504U0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
C4orf46Q504U0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
C4orf46Q504U0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
C4orf46Q504U0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
C4orf46Q504U0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
C4orf46Q504U0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms