Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TPRNQ4KMQ1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TPRNQ4KMQ1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TPRNQ4KMQ1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TPRNQ4KMQ1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TPRNQ4KMQ1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TPRNQ4KMQ1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TPRNQ4KMQ1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TPRNQ4KMQ1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TPRNQ4KMQ1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
TPRNQ4KMQ1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TPRNQ4KMQ1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TPRNQ4KMQ1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TPRNQ4KMQ1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TPRNQ4KMQ1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TPRNQ4KMQ1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TPRNQ4KMQ1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TPRNQ4KMQ1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TPRNQ4KMQ1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TPRNQ4KMQ1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TPRNQ4KMQ1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TPRNQ4KMQ1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TPRNQ4KMQ1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TPRNQ4KMQ1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TPRNQ4KMQ1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TPRNQ4KMQ1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TPRNQ4KMQ1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TPRNQ4KMQ1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TPRNQ4KMQ1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TPRNQ4KMQ1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TPRNQ4KMQ1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TPRNQ4KMQ1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TPRNQ4KMQ1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TPRNQ4KMQ1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TPRNQ4KMQ1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TPRNQ4KMQ1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TPRNQ4KMQ1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TPRNQ4KMQ1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TPRNQ4KMQ1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TPRNQ4KMQ1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TPRNQ4KMQ1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TPRNQ4KMQ1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TPRNQ4KMQ1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TPRNQ4KMQ1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TPRNQ4KMQ1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TPRNQ4KMQ1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TPRNQ4KMQ1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TPRNQ4KMQ1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TPRNQ4KMQ1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TPRNQ4KMQ1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TPRNQ4KMQ1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TPRNQ4KMQ1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TPRNQ4KMQ1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TPRNQ4KMQ1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TPRNQ4KMQ1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TPRNQ4KMQ1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TPRNQ4KMQ1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TPRNQ4KMQ1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TPRNQ4KMQ1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TPRNQ4KMQ1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TPRNQ4KMQ1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TPRNQ4KMQ1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TPRNQ4KMQ1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TPRNQ4KMQ1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TPRNQ4KMQ1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TPRNQ4KMQ1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TPRNQ4KMQ1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TPRNQ4KMQ1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TPRNQ4KMQ1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TPRNQ4KMQ1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TPRNQ4KMQ1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TPRNQ4KMQ1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TPRNQ4KMQ1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TPRNQ4KMQ1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TPRNQ4KMQ1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TPRNQ4KMQ1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TPRNQ4KMQ1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TPRNQ4KMQ1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TPRNQ4KMQ1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TPRNQ4KMQ1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TPRNQ4KMQ1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TPRNQ4KMQ1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TPRNQ4KMQ1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TPRNQ4KMQ1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TPRNQ4KMQ1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TPRNQ4KMQ1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TPRNQ4KMQ1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TPRNQ4KMQ1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TPRNQ4KMQ1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TPRNQ4KMQ1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TPRNQ4KMQ1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TPRNQ4KMQ1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TPRNQ4KMQ1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TPRNQ4KMQ1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TPRNQ4KMQ1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TPRNQ4KMQ1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TPRNQ4KMQ1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TPRNQ4KMQ1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TPRNQ4KMQ1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TPRNQ4KMQ1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
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