Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZCT1

ZNF260, Zinc finger protein 260, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF260Q3ZCT1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF260Q3ZCT1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF260Q3ZCT1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF260Q3ZCT1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF260Q3ZCT1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF260Q3ZCT1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF260Q3ZCT1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF260Q3ZCT1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF260Q3ZCT1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF260Q3ZCT1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF260Q3ZCT1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF260Q3ZCT1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF260Q3ZCT1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF260Q3ZCT1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF260Q3ZCT1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF260Q3ZCT1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF260Q3ZCT1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF260Q3ZCT1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF260Q3ZCT1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF260Q3ZCT1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF260Q3ZCT1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF260Q3ZCT1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF260Q3ZCT1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF260Q3ZCT1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF260Q3ZCT1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF260Q3ZCT1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF260Q3ZCT1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF260Q3ZCT1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF260Q3ZCT1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF260Q3ZCT1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF260Q3ZCT1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF260Q3ZCT1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF260Q3ZCT1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF260Q3ZCT1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF260Q3ZCT1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF260Q3ZCT1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF260Q3ZCT1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF260Q3ZCT1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF260Q3ZCT1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF260Q3ZCT1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF260Q3ZCT1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF260Q3ZCT1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF260Q3ZCT1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF260Q3ZCT1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF260Q3ZCT1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF260Q3ZCT1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF260Q3ZCT1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF260Q3ZCT1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF260Q3ZCT1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF260Q3ZCT1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF260Q3ZCT1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF260Q3ZCT1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF260Q3ZCT1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF260Q3ZCT1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF260Q3ZCT1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF260Q3ZCT1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF260Q3ZCT1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF260Q3ZCT1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF260Q3ZCT1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF260Q3ZCT1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF260Q3ZCT1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF260Q3ZCT1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF260Q3ZCT1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF260Q3ZCT1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF260Q3ZCT1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF260Q3ZCT1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF260Q3ZCT1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF260Q3ZCT1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF260Q3ZCT1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF260Q3ZCT1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF260Q3ZCT1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF260Q3ZCT1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF260Q3ZCT1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF260Q3ZCT1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF260Q3ZCT1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF260Q3ZCT1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF260Q3ZCT1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF260Q3ZCT1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF260Q3ZCT1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF260Q3ZCT1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF260Q3ZCT1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF260Q3ZCT1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF260Q3ZCT1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF260Q3ZCT1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF260Q3ZCT1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF260Q3ZCT1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF260Q3ZCT1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF260Q3ZCT1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF260Q3ZCT1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF260Q3ZCT1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF260Q3ZCT1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF260Q3ZCT1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF260Q3ZCT1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF260Q3ZCT1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF260Q3ZCT1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF260Q3ZCT1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF260Q3ZCT1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF260Q3ZCT1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF260Q3ZCT1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF260Q3ZCT1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms