Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZCQ8

TIMM50, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM50, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM50Q3ZCQ8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TIMM50Q3ZCQ8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TIMM50Q3ZCQ8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TIMM50Q3ZCQ8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TIMM50Q3ZCQ8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TIMM50Q3ZCQ8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TIMM50Q3ZCQ8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TIMM50Q3ZCQ8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TIMM50Q3ZCQ8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TIMM50Q3ZCQ8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TIMM50Q3ZCQ8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TIMM50Q3ZCQ8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TIMM50Q3ZCQ8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TIMM50Q3ZCQ8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TIMM50Q3ZCQ8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TIMM50Q3ZCQ8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TIMM50Q3ZCQ8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TIMM50Q3ZCQ8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TIMM50Q3ZCQ8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TIMM50Q3ZCQ8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TIMM50Q3ZCQ8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TIMM50Q3ZCQ8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TIMM50Q3ZCQ8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TIMM50Q3ZCQ8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TIMM50Q3ZCQ8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TIMM50Q3ZCQ8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TIMM50Q3ZCQ8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TIMM50Q3ZCQ8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TIMM50Q3ZCQ8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TIMM50Q3ZCQ8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TIMM50Q3ZCQ8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TIMM50Q3ZCQ8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TIMM50Q3ZCQ8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TIMM50Q3ZCQ8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TIMM50Q3ZCQ8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TIMM50Q3ZCQ8 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TIMM50Q3ZCQ8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TIMM50Q3ZCQ8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TIMM50Q3ZCQ8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TIMM50Q3ZCQ8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TIMM50Q3ZCQ8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TIMM50Q3ZCQ8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TIMM50Q3ZCQ8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TIMM50Q3ZCQ8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TIMM50Q3ZCQ8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TIMM50Q3ZCQ8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TIMM50Q3ZCQ8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TIMM50Q3ZCQ8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TIMM50Q3ZCQ8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TIMM50Q3ZCQ8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TIMM50Q3ZCQ8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TIMM50Q3ZCQ8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TIMM50Q3ZCQ8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TIMM50Q3ZCQ8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TIMM50Q3ZCQ8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TIMM50Q3ZCQ8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TIMM50Q3ZCQ8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TIMM50Q3ZCQ8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TIMM50Q3ZCQ8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TIMM50Q3ZCQ8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TIMM50Q3ZCQ8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TIMM50Q3ZCQ8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TIMM50Q3ZCQ8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TIMM50Q3ZCQ8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TIMM50Q3ZCQ8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TIMM50Q3ZCQ8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TIMM50Q3ZCQ8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TIMM50Q3ZCQ8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TIMM50Q3ZCQ8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TIMM50Q3ZCQ8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TIMM50Q3ZCQ8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TIMM50Q3ZCQ8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TIMM50Q3ZCQ8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TIMM50Q3ZCQ8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TIMM50Q3ZCQ8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TIMM50Q3ZCQ8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TIMM50Q3ZCQ8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TIMM50Q3ZCQ8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TIMM50Q3ZCQ8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TIMM50Q3ZCQ8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TIMM50Q3ZCQ8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TIMM50Q3ZCQ8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TIMM50Q3ZCQ8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TIMM50Q3ZCQ8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TIMM50Q3ZCQ8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TIMM50Q3ZCQ8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TIMM50Q3ZCQ8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TIMM50Q3ZCQ8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TIMM50Q3ZCQ8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TIMM50Q3ZCQ8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TIMM50Q3ZCQ8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TIMM50Q3ZCQ8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TIMM50Q3ZCQ8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TIMM50Q3ZCQ8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TIMM50Q3ZCQ8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TIMM50Q3ZCQ8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TIMM50Q3ZCQ8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TIMM50Q3ZCQ8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TIMM50Q3ZCQ8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TIMM50Q3ZCQ8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms