Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTLL9Q3SXZ7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTLL9Q3SXZ7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTLL9Q3SXZ7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTLL9Q3SXZ7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTLL9Q3SXZ7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTLL9Q3SXZ7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTLL9Q3SXZ7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTLL9Q3SXZ7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTLL9Q3SXZ7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTLL9Q3SXZ7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTLL9Q3SXZ7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TTLL9Q3SXZ7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTLL9Q3SXZ7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTLL9Q3SXZ7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTLL9Q3SXZ7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTLL9Q3SXZ7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTLL9Q3SXZ7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTLL9Q3SXZ7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTLL9Q3SXZ7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTLL9Q3SXZ7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTLL9Q3SXZ7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTLL9Q3SXZ7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TTLL9Q3SXZ7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TTLL9Q3SXZ7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TTLL9Q3SXZ7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TTLL9Q3SXZ7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTLL9Q3SXZ7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTLL9Q3SXZ7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTLL9Q3SXZ7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTLL9Q3SXZ7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTLL9Q3SXZ7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTLL9Q3SXZ7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTLL9Q3SXZ7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTLL9Q3SXZ7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTLL9Q3SXZ7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTLL9Q3SXZ7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTLL9Q3SXZ7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTLL9Q3SXZ7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTLL9Q3SXZ7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTLL9Q3SXZ7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTLL9Q3SXZ7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTLL9Q3SXZ7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TTLL9Q3SXZ7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTLL9Q3SXZ7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTLL9Q3SXZ7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTLL9Q3SXZ7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TTLL9Q3SXZ7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTLL9Q3SXZ7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTLL9Q3SXZ7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTLL9Q3SXZ7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTLL9Q3SXZ7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TTLL9Q3SXZ7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TTLL9Q3SXZ7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTLL9Q3SXZ7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTLL9Q3SXZ7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTLL9Q3SXZ7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTLL9Q3SXZ7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTLL9Q3SXZ7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTLL9Q3SXZ7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTLL9Q3SXZ7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTLL9Q3SXZ7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTLL9Q3SXZ7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTLL9Q3SXZ7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TTLL9Q3SXZ7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTLL9Q3SXZ7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TTLL9Q3SXZ7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTLL9Q3SXZ7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TTLL9Q3SXZ7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTLL9Q3SXZ7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTLL9Q3SXZ7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTLL9Q3SXZ7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTLL9Q3SXZ7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTLL9Q3SXZ7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTLL9Q3SXZ7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTLL9Q3SXZ7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTLL9Q3SXZ7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTLL9Q3SXZ7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTLL9Q3SXZ7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTLL9Q3SXZ7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTLL9Q3SXZ7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTLL9Q3SXZ7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTLL9Q3SXZ7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTLL9Q3SXZ7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTLL9Q3SXZ7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTLL9Q3SXZ7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTLL9Q3SXZ7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTLL9Q3SXZ7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTLL9Q3SXZ7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTLL9Q3SXZ7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTLL9Q3SXZ7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTLL9Q3SXZ7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTLL9Q3SXZ7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTLL9Q3SXZ7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTLL9Q3SXZ7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTLL9Q3SXZ7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTLL9Q3SXZ7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTLL9Q3SXZ7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTLL9Q3SXZ7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTLL9Q3SXZ7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms