Protein–RNA interactions for Protein: Q3MHD2

LSM12, Protein LSM12 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM12Q3MHD2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LSM12Q3MHD2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LSM12Q3MHD2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LSM12Q3MHD2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LSM12Q3MHD2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LSM12Q3MHD2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LSM12Q3MHD2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LSM12Q3MHD2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LSM12Q3MHD2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LSM12Q3MHD2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LSM12Q3MHD2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LSM12Q3MHD2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LSM12Q3MHD2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LSM12Q3MHD2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LSM12Q3MHD2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LSM12Q3MHD2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LSM12Q3MHD2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LSM12Q3MHD2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LSM12Q3MHD2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LSM12Q3MHD2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LSM12Q3MHD2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LSM12Q3MHD2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LSM12Q3MHD2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LSM12Q3MHD2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LSM12Q3MHD2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LSM12Q3MHD2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LSM12Q3MHD2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LSM12Q3MHD2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LSM12Q3MHD2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LSM12Q3MHD2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LSM12Q3MHD2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LSM12Q3MHD2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LSM12Q3MHD2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LSM12Q3MHD2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LSM12Q3MHD2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LSM12Q3MHD2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LSM12Q3MHD2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LSM12Q3MHD2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LSM12Q3MHD2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LSM12Q3MHD2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LSM12Q3MHD2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LSM12Q3MHD2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LSM12Q3MHD2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LSM12Q3MHD2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LSM12Q3MHD2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LSM12Q3MHD2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LSM12Q3MHD2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LSM12Q3MHD2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LSM12Q3MHD2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LSM12Q3MHD2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LSM12Q3MHD2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LSM12Q3MHD2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LSM12Q3MHD2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LSM12Q3MHD2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
LSM12Q3MHD2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LSM12Q3MHD2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
LSM12Q3MHD2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LSM12Q3MHD2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LSM12Q3MHD2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LSM12Q3MHD2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LSM12Q3MHD2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LSM12Q3MHD2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LSM12Q3MHD2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LSM12Q3MHD2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LSM12Q3MHD2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LSM12Q3MHD2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LSM12Q3MHD2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LSM12Q3MHD2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LSM12Q3MHD2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LSM12Q3MHD2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LSM12Q3MHD2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LSM12Q3MHD2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LSM12Q3MHD2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LSM12Q3MHD2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LSM12Q3MHD2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LSM12Q3MHD2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LSM12Q3MHD2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LSM12Q3MHD2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LSM12Q3MHD2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LSM12Q3MHD2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LSM12Q3MHD2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LSM12Q3MHD2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LSM12Q3MHD2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LSM12Q3MHD2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LSM12Q3MHD2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LSM12Q3MHD2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LSM12Q3MHD2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LSM12Q3MHD2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LSM12Q3MHD2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LSM12Q3MHD2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LSM12Q3MHD2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LSM12Q3MHD2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LSM12Q3MHD2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LSM12Q3MHD2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LSM12Q3MHD2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LSM12Q3MHD2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LSM12Q3MHD2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LSM12Q3MHD2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LSM12Q3MHD2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LSM12Q3MHD2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms