Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
NBPF1Q3BBV0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
NBPF1Q3BBV0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC33.8■■■■□ 3
NBPF1Q3BBV0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
NBPF1Q3BBV0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
NBPF1Q3BBV0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
NBPF1Q3BBV0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
NBPF1Q3BBV0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NBPF1Q3BBV0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NBPF1Q3BBV0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC33.79■■■■□ 3
NBPF1Q3BBV0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
NBPF1Q3BBV0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
NBPF1Q3BBV0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NBPF1Q3BBV0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
NBPF1Q3BBV0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
NBPF1Q3BBV0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
NBPF1Q3BBV0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
NBPF1Q3BBV0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
NBPF1Q3BBV0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC33.77■■■■□ 3
NBPF1Q3BBV0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
NBPF1Q3BBV0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
NBPF1Q3BBV0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
NBPF1Q3BBV0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
NBPF1Q3BBV0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
NBPF1Q3BBV0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
NBPF1Q3BBV0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
NBPF1Q3BBV0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
NBPF1Q3BBV0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
NBPF1Q3BBV0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
NBPF1Q3BBV0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
NBPF1Q3BBV0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
NBPF1Q3BBV0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
NBPF1Q3BBV0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC33.74■■■□□ 2.99
NBPF1Q3BBV0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
NBPF1Q3BBV0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
NBPF1Q3BBV0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
NBPF1Q3BBV0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NBPF1Q3BBV0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
NBPF1Q3BBV0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NBPF1Q3BBV0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NBPF1Q3BBV0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
NBPF1Q3BBV0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
NBPF1Q3BBV0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
NBPF1Q3BBV0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
NBPF1Q3BBV0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
NBPF1Q3BBV0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
NBPF1Q3BBV0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
NBPF1Q3BBV0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
NBPF1Q3BBV0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
NBPF1Q3BBV0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
NBPF1Q3BBV0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
NBPF1Q3BBV0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
NBPF1Q3BBV0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC33.7■■■□□ 2.99
NBPF1Q3BBV0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
NBPF1Q3BBV0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
NBPF1Q3BBV0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
NBPF1Q3BBV0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
NBPF1Q3BBV0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
NBPF1Q3BBV0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
NBPF1Q3BBV0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
NBPF1Q3BBV0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
NBPF1Q3BBV0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
NBPF1Q3BBV0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
NBPF1Q3BBV0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
NBPF1Q3BBV0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
NBPF1Q3BBV0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
NBPF1Q3BBV0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
NBPF1Q3BBV0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
NBPF1Q3BBV0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
NBPF1Q3BBV0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
NBPF1Q3BBV0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
NBPF1Q3BBV0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
NBPF1Q3BBV0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
NBPF1Q3BBV0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
NBPF1Q3BBV0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
NBPF1Q3BBV0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
NBPF1Q3BBV0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
NBPF1Q3BBV0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
NBPF1Q3BBV0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
NBPF1Q3BBV0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
NBPF1Q3BBV0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
NBPF1Q3BBV0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
NBPF1Q3BBV0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
NBPF1Q3BBV0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
NBPF1Q3BBV0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
NBPF1Q3BBV0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
NBPF1Q3BBV0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
NBPF1Q3BBV0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
NBPF1Q3BBV0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
NBPF1Q3BBV0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
NBPF1Q3BBV0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
NBPF1Q3BBV0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
NBPF1Q3BBV0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
NBPF1Q3BBV0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
NBPF1Q3BBV0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
NBPF1Q3BBV0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
NBPF1Q3BBV0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
NBPF1Q3BBV0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
NBPF1Q3BBV0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
NBPF1Q3BBV0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms