Protein–RNA interactions for Protein: Q2T9J0

TYSND1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYSND1Q2T9J0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TYSND1Q2T9J0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TYSND1Q2T9J0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TYSND1Q2T9J0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TYSND1Q2T9J0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TYSND1Q2T9J0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TYSND1Q2T9J0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TYSND1Q2T9J0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TYSND1Q2T9J0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TYSND1Q2T9J0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TYSND1Q2T9J0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TYSND1Q2T9J0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TYSND1Q2T9J0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TYSND1Q2T9J0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TYSND1Q2T9J0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TYSND1Q2T9J0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TYSND1Q2T9J0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TYSND1Q2T9J0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TYSND1Q2T9J0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TYSND1Q2T9J0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TYSND1Q2T9J0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TYSND1Q2T9J0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TYSND1Q2T9J0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TYSND1Q2T9J0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TYSND1Q2T9J0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TYSND1Q2T9J0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TYSND1Q2T9J0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TYSND1Q2T9J0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TYSND1Q2T9J0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TYSND1Q2T9J0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TYSND1Q2T9J0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TYSND1Q2T9J0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TYSND1Q2T9J0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TYSND1Q2T9J0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TYSND1Q2T9J0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TYSND1Q2T9J0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TYSND1Q2T9J0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TYSND1Q2T9J0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TYSND1Q2T9J0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TYSND1Q2T9J0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TYSND1Q2T9J0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TYSND1Q2T9J0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TYSND1Q2T9J0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TYSND1Q2T9J0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TYSND1Q2T9J0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TYSND1Q2T9J0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TYSND1Q2T9J0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TYSND1Q2T9J0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TYSND1Q2T9J0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TYSND1Q2T9J0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TYSND1Q2T9J0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TYSND1Q2T9J0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TYSND1Q2T9J0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TYSND1Q2T9J0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TYSND1Q2T9J0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TYSND1Q2T9J0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TYSND1Q2T9J0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TYSND1Q2T9J0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TYSND1Q2T9J0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TYSND1Q2T9J0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TYSND1Q2T9J0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TYSND1Q2T9J0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TYSND1Q2T9J0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TYSND1Q2T9J0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TYSND1Q2T9J0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TYSND1Q2T9J0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TYSND1Q2T9J0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TYSND1Q2T9J0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TYSND1Q2T9J0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TYSND1Q2T9J0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TYSND1Q2T9J0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TYSND1Q2T9J0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TYSND1Q2T9J0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TYSND1Q2T9J0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TYSND1Q2T9J0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TYSND1Q2T9J0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TYSND1Q2T9J0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TYSND1Q2T9J0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TYSND1Q2T9J0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TYSND1Q2T9J0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TYSND1Q2T9J0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TYSND1Q2T9J0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TYSND1Q2T9J0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TYSND1Q2T9J0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TYSND1Q2T9J0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TYSND1Q2T9J0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TYSND1Q2T9J0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TYSND1Q2T9J0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TYSND1Q2T9J0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TYSND1Q2T9J0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TYSND1Q2T9J0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TYSND1Q2T9J0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TYSND1Q2T9J0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TYSND1Q2T9J0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TYSND1Q2T9J0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TYSND1Q2T9J0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TYSND1Q2T9J0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TYSND1Q2T9J0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TYSND1Q2T9J0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TYSND1Q2T9J0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms