Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 827 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SKIDA1Q1XH10 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SKIDA1Q1XH10 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SKIDA1Q1XH10 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SKIDA1Q1XH10 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SKIDA1Q1XH10 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SKIDA1Q1XH10 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SKIDA1Q1XH10 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SKIDA1Q1XH10 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SKIDA1Q1XH10 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SKIDA1Q1XH10 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SKIDA1Q1XH10 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SKIDA1Q1XH10 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SKIDA1Q1XH10 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SKIDA1Q1XH10 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SKIDA1Q1XH10 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SKIDA1Q1XH10 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SKIDA1Q1XH10 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SKIDA1Q1XH10 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SKIDA1Q1XH10 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SKIDA1Q1XH10 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SKIDA1Q1XH10 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SKIDA1Q1XH10 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SKIDA1Q1XH10 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SKIDA1Q1XH10 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SKIDA1Q1XH10 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SKIDA1Q1XH10 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SKIDA1Q1XH10 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SKIDA1Q1XH10 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SKIDA1Q1XH10 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SKIDA1Q1XH10 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SKIDA1Q1XH10 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SKIDA1Q1XH10 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SKIDA1Q1XH10 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SKIDA1Q1XH10 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SKIDA1Q1XH10 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SKIDA1Q1XH10 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SKIDA1Q1XH10 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SKIDA1Q1XH10 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SKIDA1Q1XH10 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SKIDA1Q1XH10 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SKIDA1Q1XH10 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SKIDA1Q1XH10 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SKIDA1Q1XH10 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SKIDA1Q1XH10 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SKIDA1Q1XH10 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SKIDA1Q1XH10 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SKIDA1Q1XH10 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SKIDA1Q1XH10 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SKIDA1Q1XH10 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SKIDA1Q1XH10 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SKIDA1Q1XH10 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SKIDA1Q1XH10 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SKIDA1Q1XH10 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SKIDA1Q1XH10 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SKIDA1Q1XH10 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SKIDA1Q1XH10 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SKIDA1Q1XH10 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SKIDA1Q1XH10 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SKIDA1Q1XH10 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SKIDA1Q1XH10 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SKIDA1Q1XH10 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SKIDA1Q1XH10 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SKIDA1Q1XH10 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SKIDA1Q1XH10 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SKIDA1Q1XH10 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SKIDA1Q1XH10 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SKIDA1Q1XH10 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SKIDA1Q1XH10 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SKIDA1Q1XH10 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SKIDA1Q1XH10 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SKIDA1Q1XH10 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SKIDA1Q1XH10 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SKIDA1Q1XH10 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SKIDA1Q1XH10 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SKIDA1Q1XH10 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SKIDA1Q1XH10 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SKIDA1Q1XH10 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SKIDA1Q1XH10 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SKIDA1Q1XH10 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SKIDA1Q1XH10 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SKIDA1Q1XH10 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SKIDA1Q1XH10 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SKIDA1Q1XH10 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SKIDA1Q1XH10 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SKIDA1Q1XH10 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SKIDA1Q1XH10 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SKIDA1Q1XH10 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SKIDA1Q1XH10 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SKIDA1Q1XH10 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SKIDA1Q1XH10 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SKIDA1Q1XH10 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SKIDA1Q1XH10 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SKIDA1Q1XH10 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SKIDA1Q1XH10 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SKIDA1Q1XH10 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SKIDA1Q1XH10 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SKIDA1Q1XH10 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SKIDA1Q1XH10 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SKIDA1Q1XH10 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
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