Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CSPP1Q1MSJ5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CSPP1Q1MSJ5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CSPP1Q1MSJ5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CSPP1Q1MSJ5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CSPP1Q1MSJ5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CSPP1Q1MSJ5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CSPP1Q1MSJ5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CSPP1Q1MSJ5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CSPP1Q1MSJ5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CSPP1Q1MSJ5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CSPP1Q1MSJ5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CSPP1Q1MSJ5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CSPP1Q1MSJ5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CSPP1Q1MSJ5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CSPP1Q1MSJ5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CSPP1Q1MSJ5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CSPP1Q1MSJ5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CSPP1Q1MSJ5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CSPP1Q1MSJ5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CSPP1Q1MSJ5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CSPP1Q1MSJ5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CSPP1Q1MSJ5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CSPP1Q1MSJ5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CSPP1Q1MSJ5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CSPP1Q1MSJ5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CSPP1Q1MSJ5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CSPP1Q1MSJ5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CSPP1Q1MSJ5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CSPP1Q1MSJ5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CSPP1Q1MSJ5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CSPP1Q1MSJ5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CSPP1Q1MSJ5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CSPP1Q1MSJ5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CSPP1Q1MSJ5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CSPP1Q1MSJ5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CSPP1Q1MSJ5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CSPP1Q1MSJ5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CSPP1Q1MSJ5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CSPP1Q1MSJ5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CSPP1Q1MSJ5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CSPP1Q1MSJ5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CSPP1Q1MSJ5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CSPP1Q1MSJ5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CSPP1Q1MSJ5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CSPP1Q1MSJ5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CSPP1Q1MSJ5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CSPP1Q1MSJ5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CSPP1Q1MSJ5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CSPP1Q1MSJ5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CSPP1Q1MSJ5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CSPP1Q1MSJ5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CSPP1Q1MSJ5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CSPP1Q1MSJ5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CSPP1Q1MSJ5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CSPP1Q1MSJ5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CSPP1Q1MSJ5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CSPP1Q1MSJ5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CSPP1Q1MSJ5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CSPP1Q1MSJ5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CSPP1Q1MSJ5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CSPP1Q1MSJ5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CSPP1Q1MSJ5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CSPP1Q1MSJ5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CSPP1Q1MSJ5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CSPP1Q1MSJ5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CSPP1Q1MSJ5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CSPP1Q1MSJ5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CSPP1Q1MSJ5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CSPP1Q1MSJ5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CSPP1Q1MSJ5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CSPP1Q1MSJ5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CSPP1Q1MSJ5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CSPP1Q1MSJ5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CSPP1Q1MSJ5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CSPP1Q1MSJ5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CSPP1Q1MSJ5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CSPP1Q1MSJ5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CSPP1Q1MSJ5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CSPP1Q1MSJ5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CSPP1Q1MSJ5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CSPP1Q1MSJ5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CSPP1Q1MSJ5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
CSPP1Q1MSJ5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CSPP1Q1MSJ5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CSPP1Q1MSJ5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CSPP1Q1MSJ5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CSPP1Q1MSJ5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CSPP1Q1MSJ5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CSPP1Q1MSJ5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CSPP1Q1MSJ5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CSPP1Q1MSJ5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CSPP1Q1MSJ5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CSPP1Q1MSJ5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CSPP1Q1MSJ5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CSPP1Q1MSJ5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CSPP1Q1MSJ5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CSPP1Q1MSJ5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CSPP1Q1MSJ5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CSPP1Q1MSJ5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms