Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KNOP1Q1ED39 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
KNOP1Q1ED39 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KNOP1Q1ED39 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KNOP1Q1ED39 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KNOP1Q1ED39 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KNOP1Q1ED39 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KNOP1Q1ED39 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KNOP1Q1ED39 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KNOP1Q1ED39 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KNOP1Q1ED39 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
KNOP1Q1ED39 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KNOP1Q1ED39 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KNOP1Q1ED39 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KNOP1Q1ED39 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KNOP1Q1ED39 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KNOP1Q1ED39 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KNOP1Q1ED39 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
KNOP1Q1ED39 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
KNOP1Q1ED39 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KNOP1Q1ED39 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KNOP1Q1ED39 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KNOP1Q1ED39 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KNOP1Q1ED39 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KNOP1Q1ED39 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KNOP1Q1ED39 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KNOP1Q1ED39 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KNOP1Q1ED39 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KNOP1Q1ED39 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KNOP1Q1ED39 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KNOP1Q1ED39 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KNOP1Q1ED39 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KNOP1Q1ED39 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KNOP1Q1ED39 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KNOP1Q1ED39 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KNOP1Q1ED39 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KNOP1Q1ED39 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
KNOP1Q1ED39 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KNOP1Q1ED39 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KNOP1Q1ED39 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KNOP1Q1ED39 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KNOP1Q1ED39 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KNOP1Q1ED39 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KNOP1Q1ED39 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KNOP1Q1ED39 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
KNOP1Q1ED39 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KNOP1Q1ED39 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KNOP1Q1ED39 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KNOP1Q1ED39 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
KNOP1Q1ED39 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KNOP1Q1ED39 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KNOP1Q1ED39 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KNOP1Q1ED39 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KNOP1Q1ED39 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KNOP1Q1ED39 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KNOP1Q1ED39 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KNOP1Q1ED39 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KNOP1Q1ED39 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KNOP1Q1ED39 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KNOP1Q1ED39 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KNOP1Q1ED39 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KNOP1Q1ED39 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KNOP1Q1ED39 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KNOP1Q1ED39 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KNOP1Q1ED39 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KNOP1Q1ED39 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KNOP1Q1ED39 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KNOP1Q1ED39 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KNOP1Q1ED39 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KNOP1Q1ED39 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KNOP1Q1ED39 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KNOP1Q1ED39 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KNOP1Q1ED39 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
KNOP1Q1ED39 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KNOP1Q1ED39 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KNOP1Q1ED39 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KNOP1Q1ED39 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KNOP1Q1ED39 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KNOP1Q1ED39 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
KNOP1Q1ED39 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KNOP1Q1ED39 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KNOP1Q1ED39 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KNOP1Q1ED39 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KNOP1Q1ED39 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KNOP1Q1ED39 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KNOP1Q1ED39 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
KNOP1Q1ED39 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KNOP1Q1ED39 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KNOP1Q1ED39 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KNOP1Q1ED39 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KNOP1Q1ED39 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KNOP1Q1ED39 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KNOP1Q1ED39 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KNOP1Q1ED39 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KNOP1Q1ED39 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KNOP1Q1ED39 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KNOP1Q1ED39 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KNOP1Q1ED39 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KNOP1Q1ED39 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
KNOP1Q1ED39 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms