Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IMPG1Q17R60 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IMPG1Q17R60 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IMPG1Q17R60 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
IMPG1Q17R60 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IMPG1Q17R60 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IMPG1Q17R60 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IMPG1Q17R60 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IMPG1Q17R60 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IMPG1Q17R60 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IMPG1Q17R60 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IMPG1Q17R60 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IMPG1Q17R60 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IMPG1Q17R60 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IMPG1Q17R60 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IMPG1Q17R60 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IMPG1Q17R60 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IMPG1Q17R60 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IMPG1Q17R60 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IMPG1Q17R60 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IMPG1Q17R60 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IMPG1Q17R60 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IMPG1Q17R60 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IMPG1Q17R60 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IMPG1Q17R60 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IMPG1Q17R60 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IMPG1Q17R60 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IMPG1Q17R60 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IMPG1Q17R60 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IMPG1Q17R60 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IMPG1Q17R60 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
IMPG1Q17R60 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
IMPG1Q17R60 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
IMPG1Q17R60 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IMPG1Q17R60 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
IMPG1Q17R60 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IMPG1Q17R60 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IMPG1Q17R60 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IMPG1Q17R60 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
IMPG1Q17R60 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IMPG1Q17R60 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IMPG1Q17R60 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IMPG1Q17R60 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IMPG1Q17R60 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IMPG1Q17R60 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IMPG1Q17R60 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IMPG1Q17R60 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IMPG1Q17R60 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IMPG1Q17R60 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IMPG1Q17R60 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IMPG1Q17R60 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IMPG1Q17R60 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IMPG1Q17R60 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IMPG1Q17R60 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IMPG1Q17R60 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IMPG1Q17R60 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IMPG1Q17R60 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IMPG1Q17R60 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IMPG1Q17R60 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IMPG1Q17R60 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IMPG1Q17R60 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
IMPG1Q17R60 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IMPG1Q17R60 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IMPG1Q17R60 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IMPG1Q17R60 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IMPG1Q17R60 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IMPG1Q17R60 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IMPG1Q17R60 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IMPG1Q17R60 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
IMPG1Q17R60 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IMPG1Q17R60 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IMPG1Q17R60 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IMPG1Q17R60 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IMPG1Q17R60 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IMPG1Q17R60 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IMPG1Q17R60 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IMPG1Q17R60 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IMPG1Q17R60 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IMPG1Q17R60 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IMPG1Q17R60 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
IMPG1Q17R60 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IMPG1Q17R60 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IMPG1Q17R60 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IMPG1Q17R60 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IMPG1Q17R60 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IMPG1Q17R60 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IMPG1Q17R60 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IMPG1Q17R60 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IMPG1Q17R60 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
IMPG1Q17R60 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IMPG1Q17R60 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IMPG1Q17R60 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IMPG1Q17R60 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IMPG1Q17R60 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IMPG1Q17R60 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IMPG1Q17R60 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IMPG1Q17R60 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IMPG1Q17R60 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IMPG1Q17R60 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IMPG1Q17R60 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
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