Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERC1Q15751 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HERC1Q15751 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HERC1Q15751 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HERC1Q15751 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HERC1Q15751 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HERC1Q15751 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
HERC1Q15751 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERC1Q15751 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERC1Q15751 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERC1Q15751 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERC1Q15751 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERC1Q15751 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERC1Q15751 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERC1Q15751 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERC1Q15751 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERC1Q15751 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERC1Q15751 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERC1Q15751 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERC1Q15751 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HERC1Q15751 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HERC1Q15751 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HERC1Q15751 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
HERC1Q15751 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HERC1Q15751 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
HERC1Q15751 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
HERC1Q15751 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
HERC1Q15751 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
HERC1Q15751 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
HERC1Q15751 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
HERC1Q15751 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
HERC1Q15751 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
HERC1Q15751 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
HERC1Q15751 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
HERC1Q15751 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERC1Q15751 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERC1Q15751 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERC1Q15751 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERC1Q15751 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERC1Q15751 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERC1Q15751 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERC1Q15751 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERC1Q15751 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERC1Q15751 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERC1Q15751 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
HERC1Q15751 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERC1Q15751 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERC1Q15751 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERC1Q15751 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERC1Q15751 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERC1Q15751 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERC1Q15751 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERC1Q15751 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERC1Q15751 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
HERC1Q15751 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERC1Q15751 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HERC1Q15751 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HERC1Q15751 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HERC1Q15751 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HERC1Q15751 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HERC1Q15751 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
HERC1Q15751 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HERC1Q15751 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HERC1Q15751 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
HERC1Q15751 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HERC1Q15751 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HERC1Q15751 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HERC1Q15751 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HERC1Q15751 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HERC1Q15751 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HERC1Q15751 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HERC1Q15751 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HERC1Q15751 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HERC1Q15751 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HERC1Q15751 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HERC1Q15751 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HERC1Q15751 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
HERC1Q15751 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HERC1Q15751 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HERC1Q15751 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HERC1Q15751 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HERC1Q15751 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HERC1Q15751 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HERC1Q15751 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HERC1Q15751 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HERC1Q15751 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HERC1Q15751 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HERC1Q15751 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HERC1Q15751 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HERC1Q15751 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HERC1Q15751 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HERC1Q15751 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HERC1Q15751 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HERC1Q15751 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HERC1Q15751 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HERC1Q15751 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HERC1Q15751 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HERC1Q15751 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HERC1Q15751 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HERC1Q15751 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
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