Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SF1Q15637 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SF1Q15637 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SF1Q15637 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SF1Q15637 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SF1Q15637 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SF1Q15637 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SF1Q15637 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SF1Q15637 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SF1Q15637 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SF1Q15637 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SF1Q15637 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SF1Q15637 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SF1Q15637 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SF1Q15637 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SF1Q15637 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SF1Q15637 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SF1Q15637 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SF1Q15637 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SF1Q15637 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SF1Q15637 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SF1Q15637 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SF1Q15637 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SF1Q15637 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SF1Q15637 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SF1Q15637 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SF1Q15637 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SF1Q15637 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SF1Q15637 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SF1Q15637 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SF1Q15637 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SF1Q15637 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SF1Q15637 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SF1Q15637 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SF1Q15637 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SF1Q15637 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SF1Q15637 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SF1Q15637 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SF1Q15637 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SF1Q15637 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SF1Q15637 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SF1Q15637 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SF1Q15637 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SF1Q15637 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SF1Q15637 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SF1Q15637 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SF1Q15637 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SF1Q15637 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SF1Q15637 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SF1Q15637 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SF1Q15637 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SF1Q15637 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SF1Q15637 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
SF1Q15637 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SF1Q15637 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SF1Q15637 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SF1Q15637 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SF1Q15637 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SF1Q15637 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SF1Q15637 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SF1Q15637 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SF1Q15637 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SF1Q15637 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SF1Q15637 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SF1Q15637 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SF1Q15637 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SF1Q15637 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SF1Q15637 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SF1Q15637 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SF1Q15637 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SF1Q15637 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SF1Q15637 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SF1Q15637 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SF1Q15637 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SF1Q15637 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SF1Q15637 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SF1Q15637 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SF1Q15637 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SF1Q15637 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SF1Q15637 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SF1Q15637 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SF1Q15637 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SF1Q15637 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SF1Q15637 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SF1Q15637 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SF1Q15637 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SF1Q15637 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SF1Q15637 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SF1Q15637 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SF1Q15637 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SF1Q15637 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SF1Q15637 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SF1Q15637 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SF1Q15637 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SF1Q15637 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SF1Q15637 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SF1Q15637 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SF1Q15637 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SF1Q15637 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SF1Q15637 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
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