Protein–RNA interactions for Protein: Q15599

SLC9A3R2, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF2, humanhuman

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Length 337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3R2Q15599 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC9A3R2Q15599 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC9A3R2Q15599 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC9A3R2Q15599 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC9A3R2Q15599 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC9A3R2Q15599 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC9A3R2Q15599 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC9A3R2Q15599 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC9A3R2Q15599 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC9A3R2Q15599 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC9A3R2Q15599 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC9A3R2Q15599 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC9A3R2Q15599 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC9A3R2Q15599 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC9A3R2Q15599 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC9A3R2Q15599 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC9A3R2Q15599 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC9A3R2Q15599 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC9A3R2Q15599 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC9A3R2Q15599 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC9A3R2Q15599 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC9A3R2Q15599 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC9A3R2Q15599 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC9A3R2Q15599 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC9A3R2Q15599 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC9A3R2Q15599 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC9A3R2Q15599 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC9A3R2Q15599 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC9A3R2Q15599 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC9A3R2Q15599 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC9A3R2Q15599 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC9A3R2Q15599 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC9A3R2Q15599 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC9A3R2Q15599 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC9A3R2Q15599 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC9A3R2Q15599 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC9A3R2Q15599 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC9A3R2Q15599 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC9A3R2Q15599 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC9A3R2Q15599 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SLC9A3R2Q15599 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SLC9A3R2Q15599 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SLC9A3R2Q15599 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC9A3R2Q15599 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC9A3R2Q15599 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC9A3R2Q15599 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC9A3R2Q15599 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC9A3R2Q15599 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC9A3R2Q15599 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC9A3R2Q15599 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC9A3R2Q15599 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC9A3R2Q15599 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC9A3R2Q15599 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC9A3R2Q15599 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC9A3R2Q15599 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC9A3R2Q15599 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC9A3R2Q15599 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC9A3R2Q15599 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC9A3R2Q15599 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC9A3R2Q15599 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC9A3R2Q15599 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC9A3R2Q15599 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC9A3R2Q15599 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC9A3R2Q15599 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC9A3R2Q15599 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC9A3R2Q15599 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC9A3R2Q15599 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC9A3R2Q15599 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC9A3R2Q15599 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC9A3R2Q15599 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC9A3R2Q15599 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC9A3R2Q15599 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC9A3R2Q15599 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC9A3R2Q15599 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC9A3R2Q15599 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC9A3R2Q15599 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC9A3R2Q15599 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC9A3R2Q15599 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC9A3R2Q15599 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC9A3R2Q15599 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC9A3R2Q15599 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC9A3R2Q15599 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC9A3R2Q15599 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC9A3R2Q15599 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC9A3R2Q15599 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC9A3R2Q15599 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC9A3R2Q15599 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC9A3R2Q15599 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC9A3R2Q15599 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC9A3R2Q15599 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC9A3R2Q15599 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC9A3R2Q15599 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC9A3R2Q15599 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC9A3R2Q15599 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC9A3R2Q15599 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC9A3R2Q15599 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC9A3R2Q15599 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC9A3R2Q15599 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC9A3R2Q15599 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC9A3R2Q15599 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
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