Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRRQ15256 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRRQ15256 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRRQ15256 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRRQ15256 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRRQ15256 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRRQ15256 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRRQ15256 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRRQ15256 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRRQ15256 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRRQ15256 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRRQ15256 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRRQ15256 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRRQ15256 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRRQ15256 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRRQ15256 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRRQ15256 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRRQ15256 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRRQ15256 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRRQ15256 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRRQ15256 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRRQ15256 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRRQ15256 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRRQ15256 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRRQ15256 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRRQ15256 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRRQ15256 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRRQ15256 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRRQ15256 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRRQ15256 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRRQ15256 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRRQ15256 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRRQ15256 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRRQ15256 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRRQ15256 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRRQ15256 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRRQ15256 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRRQ15256 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRRQ15256 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRRQ15256 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRRQ15256 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRRQ15256 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRRQ15256 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRRQ15256 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRRQ15256 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRRQ15256 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRRQ15256 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRRQ15256 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRRQ15256 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRRQ15256 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRRQ15256 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRRQ15256 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRRQ15256 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRRQ15256 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRRQ15256 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRRQ15256 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRRQ15256 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRRQ15256 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRRQ15256 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRRQ15256 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRRQ15256 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRRQ15256 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRRQ15256 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRRQ15256 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRRQ15256 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRRQ15256 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRRQ15256 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRRQ15256 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRRQ15256 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRRQ15256 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRRQ15256 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRRQ15256 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRRQ15256 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRRQ15256 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRRQ15256 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRRQ15256 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRRQ15256 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRRQ15256 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRRQ15256 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRRQ15256 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRRQ15256 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRRQ15256 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRRQ15256 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRRQ15256 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRRQ15256 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRRQ15256 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRRQ15256 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRRQ15256 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRRQ15256 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRRQ15256 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRRQ15256 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRRQ15256 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRRQ15256 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRRQ15256 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRRQ15256 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRRQ15256 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRRQ15256 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRRQ15256 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRRQ15256 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRRQ15256 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms