Protein–RNA interactions for Protein: Q15118

PDK1, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK1Q15118 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDK1Q15118 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDK1Q15118 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDK1Q15118 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDK1Q15118 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDK1Q15118 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDK1Q15118 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDK1Q15118 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDK1Q15118 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDK1Q15118 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDK1Q15118 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDK1Q15118 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDK1Q15118 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDK1Q15118 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDK1Q15118 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDK1Q15118 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDK1Q15118 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDK1Q15118 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDK1Q15118 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDK1Q15118 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PDK1Q15118 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDK1Q15118 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDK1Q15118 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDK1Q15118 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDK1Q15118 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDK1Q15118 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDK1Q15118 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDK1Q15118 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDK1Q15118 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDK1Q15118 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDK1Q15118 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDK1Q15118 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDK1Q15118 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDK1Q15118 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDK1Q15118 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDK1Q15118 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDK1Q15118 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDK1Q15118 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PDK1Q15118 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDK1Q15118 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDK1Q15118 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDK1Q15118 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDK1Q15118 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDK1Q15118 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDK1Q15118 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDK1Q15118 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDK1Q15118 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDK1Q15118 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDK1Q15118 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PDK1Q15118 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDK1Q15118 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PDK1Q15118 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDK1Q15118 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDK1Q15118 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PDK1Q15118 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDK1Q15118 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDK1Q15118 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDK1Q15118 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDK1Q15118 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PDK1Q15118 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDK1Q15118 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDK1Q15118 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDK1Q15118 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDK1Q15118 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDK1Q15118 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDK1Q15118 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDK1Q15118 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDK1Q15118 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDK1Q15118 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDK1Q15118 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDK1Q15118 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDK1Q15118 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDK1Q15118 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDK1Q15118 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDK1Q15118 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDK1Q15118 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDK1Q15118 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDK1Q15118 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDK1Q15118 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PDK1Q15118 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDK1Q15118 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDK1Q15118 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDK1Q15118 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PDK1Q15118 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDK1Q15118 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDK1Q15118 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PDK1Q15118 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDK1Q15118 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDK1Q15118 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDK1Q15118 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDK1Q15118 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDK1Q15118 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDK1Q15118 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDK1Q15118 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDK1Q15118 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDK1Q15118 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PDK1Q15118 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PDK1Q15118 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDK1Q15118 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PDK1Q15118 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
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