Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM25Q14258 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM25Q14258 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM25Q14258 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM25Q14258 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM25Q14258 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM25Q14258 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM25Q14258 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM25Q14258 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM25Q14258 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM25Q14258 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM25Q14258 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM25Q14258 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM25Q14258 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM25Q14258 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM25Q14258 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM25Q14258 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM25Q14258 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM25Q14258 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM25Q14258 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM25Q14258 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM25Q14258 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM25Q14258 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM25Q14258 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM25Q14258 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM25Q14258 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM25Q14258 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM25Q14258 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM25Q14258 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM25Q14258 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM25Q14258 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM25Q14258 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM25Q14258 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM25Q14258 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM25Q14258 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM25Q14258 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM25Q14258 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM25Q14258 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM25Q14258 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM25Q14258 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM25Q14258 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM25Q14258 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM25Q14258 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM25Q14258 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM25Q14258 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM25Q14258 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM25Q14258 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM25Q14258 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM25Q14258 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM25Q14258 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM25Q14258 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM25Q14258 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM25Q14258 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM25Q14258 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM25Q14258 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM25Q14258 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM25Q14258 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM25Q14258 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM25Q14258 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM25Q14258 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM25Q14258 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM25Q14258 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM25Q14258 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM25Q14258 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM25Q14258 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM25Q14258 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM25Q14258 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM25Q14258 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM25Q14258 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM25Q14258 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM25Q14258 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM25Q14258 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM25Q14258 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM25Q14258 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM25Q14258 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM25Q14258 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM25Q14258 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM25Q14258 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM25Q14258 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM25Q14258 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM25Q14258 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM25Q14258 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM25Q14258 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM25Q14258 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM25Q14258 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM25Q14258 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM25Q14258 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM25Q14258 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM25Q14258 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM25Q14258 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM25Q14258 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM25Q14258 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM25Q14258 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM25Q14258 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM25Q14258 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM25Q14258 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM25Q14258 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM25Q14258 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM25Q14258 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM25Q14258 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
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