Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MTMR3Q13615 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MTMR3Q13615 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
MTMR3Q13615 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MTMR3Q13615 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MTMR3Q13615 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
MTMR3Q13615 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MTMR3Q13615 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MTMR3Q13615 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MTMR3Q13615 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MTMR3Q13615 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MTMR3Q13615 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MTMR3Q13615 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MTMR3Q13615 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MTMR3Q13615 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MTMR3Q13615 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MTMR3Q13615 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MTMR3Q13615 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MTMR3Q13615 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MTMR3Q13615 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MTMR3Q13615 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MTMR3Q13615 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MTMR3Q13615 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MTMR3Q13615 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MTMR3Q13615 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MTMR3Q13615 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MTMR3Q13615 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MTMR3Q13615 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MTMR3Q13615 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MTMR3Q13615 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MTMR3Q13615 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MTMR3Q13615 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MTMR3Q13615 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MTMR3Q13615 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MTMR3Q13615 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MTMR3Q13615 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MTMR3Q13615 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MTMR3Q13615 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MTMR3Q13615 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MTMR3Q13615 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MTMR3Q13615 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MTMR3Q13615 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MTMR3Q13615 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MTMR3Q13615 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MTMR3Q13615 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MTMR3Q13615 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MTMR3Q13615 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MTMR3Q13615 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MTMR3Q13615 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MTMR3Q13615 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MTMR3Q13615 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MTMR3Q13615 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
MTMR3Q13615 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MTMR3Q13615 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MTMR3Q13615 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
MTMR3Q13615 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MTMR3Q13615 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MTMR3Q13615 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
MTMR3Q13615 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MTMR3Q13615 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MTMR3Q13615 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MTMR3Q13615 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
MTMR3Q13615 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MTMR3Q13615 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MTMR3Q13615 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MTMR3Q13615 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MTMR3Q13615 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MTMR3Q13615 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MTMR3Q13615 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MTMR3Q13615 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MTMR3Q13615 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MTMR3Q13615 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MTMR3Q13615 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MTMR3Q13615 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MTMR3Q13615 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MTMR3Q13615 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MTMR3Q13615 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MTMR3Q13615 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MTMR3Q13615 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MTMR3Q13615 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
MTMR3Q13615 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
MTMR3Q13615 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MTMR3Q13615 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MTMR3Q13615 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MTMR3Q13615 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MTMR3Q13615 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MTMR3Q13615 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MTMR3Q13615 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MTMR3Q13615 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MTMR3Q13615 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MTMR3Q13615 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
MTMR3Q13615 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
MTMR3Q13615 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MTMR3Q13615 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MTMR3Q13615 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
MTMR3Q13615 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MTMR3Q13615 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MTMR3Q13615 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MTMR3Q13615 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MTMR3Q13615 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
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