Protein–RNA interactions for Protein: Q13445

TMED1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1Q13445 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMED1Q13445 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMED1Q13445 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMED1Q13445 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMED1Q13445 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMED1Q13445 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMED1Q13445 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMED1Q13445 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMED1Q13445 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMED1Q13445 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMED1Q13445 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMED1Q13445 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMED1Q13445 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMED1Q13445 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMED1Q13445 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMED1Q13445 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMED1Q13445 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMED1Q13445 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMED1Q13445 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
TMED1Q13445 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMED1Q13445 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMED1Q13445 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMED1Q13445 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMED1Q13445 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMED1Q13445 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMED1Q13445 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMED1Q13445 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMED1Q13445 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMED1Q13445 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMED1Q13445 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMED1Q13445 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMED1Q13445 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMED1Q13445 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMED1Q13445 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMED1Q13445 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMED1Q13445 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMED1Q13445 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMED1Q13445 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMED1Q13445 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMED1Q13445 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMED1Q13445 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMED1Q13445 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMED1Q13445 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMED1Q13445 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMED1Q13445 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMED1Q13445 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMED1Q13445 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMED1Q13445 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMED1Q13445 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMED1Q13445 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMED1Q13445 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMED1Q13445 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMED1Q13445 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMED1Q13445 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMED1Q13445 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMED1Q13445 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMED1Q13445 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMED1Q13445 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMED1Q13445 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMED1Q13445 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMED1Q13445 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TMED1Q13445 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMED1Q13445 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMED1Q13445 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMED1Q13445 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMED1Q13445 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMED1Q13445 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMED1Q13445 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMED1Q13445 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMED1Q13445 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMED1Q13445 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMED1Q13445 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMED1Q13445 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMED1Q13445 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMED1Q13445 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMED1Q13445 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMED1Q13445 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMED1Q13445 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMED1Q13445 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMED1Q13445 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMED1Q13445 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMED1Q13445 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMED1Q13445 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMED1Q13445 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMED1Q13445 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMED1Q13445 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMED1Q13445 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMED1Q13445 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMED1Q13445 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMED1Q13445 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMED1Q13445 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMED1Q13445 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMED1Q13445 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMED1Q13445 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMED1Q13445 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMED1Q13445 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMED1Q13445 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TMED1Q13445 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMED1Q13445 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMED1Q13445 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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