Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SP140Q13342 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SP140Q13342 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SP140Q13342 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SP140Q13342 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SP140Q13342 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SP140Q13342 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SP140Q13342 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SP140Q13342 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SP140Q13342 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SP140Q13342 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SP140Q13342 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SP140Q13342 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SP140Q13342 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SP140Q13342 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SP140Q13342 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SP140Q13342 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SP140Q13342 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SP140Q13342 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SP140Q13342 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SP140Q13342 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SP140Q13342 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SP140Q13342 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SP140Q13342 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SP140Q13342 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SP140Q13342 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SP140Q13342 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SP140Q13342 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SP140Q13342 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SP140Q13342 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SP140Q13342 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SP140Q13342 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SP140Q13342 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SP140Q13342 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SP140Q13342 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SP140Q13342 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SP140Q13342 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SP140Q13342 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SP140Q13342 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SP140Q13342 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SP140Q13342 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SP140Q13342 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SP140Q13342 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SP140Q13342 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SP140Q13342 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SP140Q13342 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SP140Q13342 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SP140Q13342 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SP140Q13342 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SP140Q13342 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SP140Q13342 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SP140Q13342 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SP140Q13342 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SP140Q13342 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SP140Q13342 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SP140Q13342 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SP140Q13342 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SP140Q13342 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SP140Q13342 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SP140Q13342 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SP140Q13342 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SP140Q13342 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SP140Q13342 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SP140Q13342 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SP140Q13342 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SP140Q13342 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SP140Q13342 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SP140Q13342 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SP140Q13342 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SP140Q13342 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SP140Q13342 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
SP140Q13342 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SP140Q13342 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SP140Q13342 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SP140Q13342 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SP140Q13342 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SP140Q13342 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SP140Q13342 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SP140Q13342 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SP140Q13342 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SP140Q13342 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SP140Q13342 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SP140Q13342 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SP140Q13342 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SP140Q13342 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SP140Q13342 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SP140Q13342 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SP140Q13342 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SP140Q13342 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SP140Q13342 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SP140Q13342 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SP140Q13342 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SP140Q13342 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SP140Q13342 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SP140Q13342 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SP140Q13342 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SP140Q13342 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SP140Q13342 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SP140Q13342 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SP140Q13342 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.1 ms