Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
APOBRQ0VD83 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
APOBRQ0VD83 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
APOBRQ0VD83 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
APOBRQ0VD83 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
APOBRQ0VD83 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
APOBRQ0VD83 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
APOBRQ0VD83 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
APOBRQ0VD83 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
APOBRQ0VD83 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
APOBRQ0VD83 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
APOBRQ0VD83 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
APOBRQ0VD83 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
APOBRQ0VD83 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
APOBRQ0VD83 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
APOBRQ0VD83 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
APOBRQ0VD83 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
APOBRQ0VD83 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
APOBRQ0VD83 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
APOBRQ0VD83 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
APOBRQ0VD83 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
APOBRQ0VD83 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
APOBRQ0VD83 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
APOBRQ0VD83 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
APOBRQ0VD83 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
APOBRQ0VD83 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
APOBRQ0VD83 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
APOBRQ0VD83 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
APOBRQ0VD83 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
APOBRQ0VD83 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
APOBRQ0VD83 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
APOBRQ0VD83 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
APOBRQ0VD83 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
APOBRQ0VD83 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
APOBRQ0VD83 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
APOBRQ0VD83 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
APOBRQ0VD83 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
APOBRQ0VD83 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
APOBRQ0VD83 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
APOBRQ0VD83 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
APOBRQ0VD83 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
APOBRQ0VD83 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
APOBRQ0VD83 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
APOBRQ0VD83 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
APOBRQ0VD83 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
APOBRQ0VD83 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
APOBRQ0VD83 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
APOBRQ0VD83 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
APOBRQ0VD83 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
APOBRQ0VD83 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
APOBRQ0VD83 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
APOBRQ0VD83 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
APOBRQ0VD83 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
APOBRQ0VD83 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
APOBRQ0VD83 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
APOBRQ0VD83 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
APOBRQ0VD83 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
APOBRQ0VD83 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
APOBRQ0VD83 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
APOBRQ0VD83 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
APOBRQ0VD83 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
APOBRQ0VD83 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
APOBRQ0VD83 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
APOBRQ0VD83 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
APOBRQ0VD83 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
APOBRQ0VD83 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
APOBRQ0VD83 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
APOBRQ0VD83 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
APOBRQ0VD83 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
APOBRQ0VD83 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
APOBRQ0VD83 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
APOBRQ0VD83 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
APOBRQ0VD83 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
APOBRQ0VD83 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
APOBRQ0VD83 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
APOBRQ0VD83 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
APOBRQ0VD83 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
APOBRQ0VD83 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
APOBRQ0VD83 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
APOBRQ0VD83 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
APOBRQ0VD83 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
APOBRQ0VD83 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
APOBRQ0VD83 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
APOBRQ0VD83 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
APOBRQ0VD83 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
APOBRQ0VD83 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
APOBRQ0VD83 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
APOBRQ0VD83 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
APOBRQ0VD83 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
APOBRQ0VD83 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
APOBRQ0VD83 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
APOBRQ0VD83 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
APOBRQ0VD83 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
APOBRQ0VD83 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
APOBRQ0VD83 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
APOBRQ0VD83 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
APOBRQ0VD83 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
APOBRQ0VD83 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
APOBRQ0VD83 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
APOBRQ0VD83 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms