Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAQ4

SMAGP, Small cell adhesion glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAGPQ0VAQ4 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMAGPQ0VAQ4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMAGPQ0VAQ4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMAGPQ0VAQ4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMAGPQ0VAQ4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMAGPQ0VAQ4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMAGPQ0VAQ4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMAGPQ0VAQ4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMAGPQ0VAQ4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMAGPQ0VAQ4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMAGPQ0VAQ4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMAGPQ0VAQ4 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SMAGPQ0VAQ4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SMAGPQ0VAQ4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMAGPQ0VAQ4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMAGPQ0VAQ4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMAGPQ0VAQ4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMAGPQ0VAQ4 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMAGPQ0VAQ4 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMAGPQ0VAQ4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMAGPQ0VAQ4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMAGPQ0VAQ4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMAGPQ0VAQ4 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMAGPQ0VAQ4 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMAGPQ0VAQ4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMAGPQ0VAQ4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMAGPQ0VAQ4 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMAGPQ0VAQ4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMAGPQ0VAQ4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMAGPQ0VAQ4 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMAGPQ0VAQ4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMAGPQ0VAQ4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMAGPQ0VAQ4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMAGPQ0VAQ4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMAGPQ0VAQ4 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMAGPQ0VAQ4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMAGPQ0VAQ4 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMAGPQ0VAQ4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMAGPQ0VAQ4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMAGPQ0VAQ4 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMAGPQ0VAQ4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMAGPQ0VAQ4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMAGPQ0VAQ4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMAGPQ0VAQ4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMAGPQ0VAQ4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMAGPQ0VAQ4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMAGPQ0VAQ4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMAGPQ0VAQ4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMAGPQ0VAQ4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMAGPQ0VAQ4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMAGPQ0VAQ4 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMAGPQ0VAQ4 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMAGPQ0VAQ4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMAGPQ0VAQ4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMAGPQ0VAQ4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMAGPQ0VAQ4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMAGPQ0VAQ4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMAGPQ0VAQ4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMAGPQ0VAQ4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMAGPQ0VAQ4 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMAGPQ0VAQ4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMAGPQ0VAQ4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMAGPQ0VAQ4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SMAGPQ0VAQ4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMAGPQ0VAQ4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMAGPQ0VAQ4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMAGPQ0VAQ4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMAGPQ0VAQ4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMAGPQ0VAQ4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMAGPQ0VAQ4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SMAGPQ0VAQ4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMAGPQ0VAQ4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMAGPQ0VAQ4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMAGPQ0VAQ4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMAGPQ0VAQ4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMAGPQ0VAQ4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMAGPQ0VAQ4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMAGPQ0VAQ4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMAGPQ0VAQ4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMAGPQ0VAQ4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMAGPQ0VAQ4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMAGPQ0VAQ4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMAGPQ0VAQ4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMAGPQ0VAQ4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMAGPQ0VAQ4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMAGPQ0VAQ4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMAGPQ0VAQ4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SMAGPQ0VAQ4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMAGPQ0VAQ4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SMAGPQ0VAQ4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMAGPQ0VAQ4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMAGPQ0VAQ4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMAGPQ0VAQ4 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMAGPQ0VAQ4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMAGPQ0VAQ4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMAGPQ0VAQ4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMAGPQ0VAQ4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMAGPQ0VAQ4 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMAGPQ0VAQ4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMAGPQ0VAQ4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms