Protein–RNA interactions for Protein: Q08043

ACTN3, Alpha-actinin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN3Q08043 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTN3Q08043 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTN3Q08043 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTN3Q08043 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTN3Q08043 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTN3Q08043 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTN3Q08043 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTN3Q08043 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTN3Q08043 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTN3Q08043 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTN3Q08043 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTN3Q08043 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACTN3Q08043 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACTN3Q08043 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACTN3Q08043 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ACTN3Q08043 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ACTN3Q08043 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ACTN3Q08043 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ACTN3Q08043 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACTN3Q08043 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACTN3Q08043 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACTN3Q08043 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACTN3Q08043 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACTN3Q08043 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACTN3Q08043 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACTN3Q08043 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACTN3Q08043 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ACTN3Q08043 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACTN3Q08043 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACTN3Q08043 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACTN3Q08043 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACTN3Q08043 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACTN3Q08043 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACTN3Q08043 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACTN3Q08043 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACTN3Q08043 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACTN3Q08043 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACTN3Q08043 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACTN3Q08043 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACTN3Q08043 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACTN3Q08043 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACTN3Q08043 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ACTN3Q08043 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACTN3Q08043 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACTN3Q08043 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACTN3Q08043 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACTN3Q08043 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACTN3Q08043 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACTN3Q08043 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACTN3Q08043 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACTN3Q08043 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACTN3Q08043 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACTN3Q08043 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACTN3Q08043 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACTN3Q08043 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACTN3Q08043 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACTN3Q08043 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACTN3Q08043 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACTN3Q08043 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACTN3Q08043 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACTN3Q08043 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACTN3Q08043 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACTN3Q08043 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACTN3Q08043 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACTN3Q08043 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACTN3Q08043 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ACTN3Q08043 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACTN3Q08043 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACTN3Q08043 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACTN3Q08043 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACTN3Q08043 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACTN3Q08043 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACTN3Q08043 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACTN3Q08043 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACTN3Q08043 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACTN3Q08043 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACTN3Q08043 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACTN3Q08043 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACTN3Q08043 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACTN3Q08043 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACTN3Q08043 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACTN3Q08043 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACTN3Q08043 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACTN3Q08043 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACTN3Q08043 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACTN3Q08043 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACTN3Q08043 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACTN3Q08043 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACTN3Q08043 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACTN3Q08043 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACTN3Q08043 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACTN3Q08043 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACTN3Q08043 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACTN3Q08043 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACTN3Q08043 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACTN3Q08043 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACTN3Q08043 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACTN3Q08043 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACTN3Q08043 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACTN3Q08043 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms