Protein–RNA interactions for Protein: Q07326

PIGF, Phosphatidylinositol-glycan biosynthesis class F protein, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIGFQ07326 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PIGFQ07326 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PIGFQ07326 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PIGFQ07326 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PIGFQ07326 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PIGFQ07326 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PIGFQ07326 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PIGFQ07326 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PIGFQ07326 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PIGFQ07326 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PIGFQ07326 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PIGFQ07326 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PIGFQ07326 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PIGFQ07326 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PIGFQ07326 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PIGFQ07326 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PIGFQ07326 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PIGFQ07326 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PIGFQ07326 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PIGFQ07326 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PIGFQ07326 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PIGFQ07326 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PIGFQ07326 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PIGFQ07326 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PIGFQ07326 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PIGFQ07326 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIGFQ07326 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIGFQ07326 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIGFQ07326 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIGFQ07326 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIGFQ07326 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIGFQ07326 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIGFQ07326 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIGFQ07326 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIGFQ07326 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIGFQ07326 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIGFQ07326 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIGFQ07326 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIGFQ07326 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PIGFQ07326 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIGFQ07326 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PIGFQ07326 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PIGFQ07326 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PIGFQ07326 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PIGFQ07326 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PIGFQ07326 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PIGFQ07326 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PIGFQ07326 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PIGFQ07326 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PIGFQ07326 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PIGFQ07326 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PIGFQ07326 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PIGFQ07326 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PIGFQ07326 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PIGFQ07326 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PIGFQ07326 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PIGFQ07326 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PIGFQ07326 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PIGFQ07326 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PIGFQ07326 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PIGFQ07326 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PIGFQ07326 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PIGFQ07326 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PIGFQ07326 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PIGFQ07326 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PIGFQ07326 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PIGFQ07326 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PIGFQ07326 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PIGFQ07326 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PIGFQ07326 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PIGFQ07326 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PIGFQ07326 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PIGFQ07326 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PIGFQ07326 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PIGFQ07326 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PIGFQ07326 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PIGFQ07326 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PIGFQ07326 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PIGFQ07326 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PIGFQ07326 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PIGFQ07326 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PIGFQ07326 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PIGFQ07326 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PIGFQ07326 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PIGFQ07326 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PIGFQ07326 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PIGFQ07326 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PIGFQ07326 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PIGFQ07326 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PIGFQ07326 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PIGFQ07326 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PIGFQ07326 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PIGFQ07326 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PIGFQ07326 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PIGFQ07326 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PIGFQ07326 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PIGFQ07326 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PIGFQ07326 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PIGFQ07326 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PIGFQ07326 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms