Protein–RNA interactions for Protein: Q04116

YHP1, Homeobox protein YHP1, yeastyeast

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHP1Q04116 SSK22YCR073C 3996 nt4.67□□□□□ -1.66
YHP1Q04116 GYP1YOR070C 1914 nt4.66□□□□□ -1.66
YHP1Q04116 CIN4YMR138W 576 nt4.66□□□□□ -1.66
YHP1Q04116 UIP4YPL186C 915 nt4.66□□□□□ -1.66
YHP1Q04116 SMF2YHR050W 1650 nt4.66□□□□□ -1.66
YHP1Q04116 TBF1YPL128C 1689 nt4.66□□□□□ -1.66
YHP1Q04116 PFA3YNL326C 1011 nt4.65□□□□□ -1.67
YHP1Q04116 ADE12YNL220W 1302 nt4.65□□□□□ -1.67
YHP1Q04116 ASH1YKL185W 1767 nt4.65□□□□□ -1.67
YHP1Q04116 VRP1YLR337C 2454 nt4.65□□□□□ -1.67
YHP1Q04116 GSY2YLR258W 2118 nt4.64□□□□□ -1.67
YHP1Q04116 DUG1YFR044C 1446 nt4.64□□□□□ -1.67
YHP1Q04116 AMD1YML035C 2433 nt4.64□□□□□ -1.67
YHP1Q04116 YLR317WYLR317W 435 nt4.64□□□□□ -1.67
YHP1Q04116 ECM19YLR390W 339 nt4.64□□□□□ -1.67
YHP1Q04116 RPS9AYPL081W 594 nt4.64□□□□□ -1.67
YHP1Q04116 YBR144CYBR144C 315 nt4.64□□□□□ -1.67
YHP1Q04116 PRI2YKL045W 1587 nt4.64□□□□□ -1.67
YHP1Q04116 HSF1YGL073W 2502 nt4.63□□□□□ -1.67
YHP1Q04116 POR1YNL055C 852 nt4.63□□□□□ -1.67
YHP1Q04116 MRPS5YBR251W 924 nt4.63□□□□□ -1.67
YHP1Q04116 PCS60YBR222C 1632 nt4.63□□□□□ -1.67
YHP1Q04116 VNX1YNL321W 2727 nt4.62□□□□□ -1.67
YHP1Q04116 SNZ3YFL059W 897 nt4.62□□□□□ -1.67
YHP1Q04116 SIP2YGL208W 1248 nt4.62□□□□□ -1.67
YHP1Q04116 APS3YJL024C 585 nt4.62□□□□□ -1.67
YHP1Q04116 SEN34YAR008W 828 nt4.62□□□□□ -1.67
YHP1Q04116 YLR126CYLR126C 756 nt4.62□□□□□ -1.67
YHP1Q04116 YML012C-AYML012C-A 378 nt4.62□□□□□ -1.67
YHP1Q04116 SNZ2YNL333W 897 nt4.62□□□□□ -1.67
YHP1Q04116 SUB2YDL084W 1341 nt4.62□□□□□ -1.67
YHP1Q04116 TRP3YKL211C 1455 nt4.62□□□□□ -1.67
YHP1Q04116 ACC1YNR016C 6702 nt4.61□□□□□ -1.67
YHP1Q04116 YNL017CYNL017C 339 nt4.61□□□□□ -1.67
YHP1Q04116 RRT2YBR246W 1164 nt4.61□□□□□ -1.67
YHP1Q04116 MNS1YJR131W 1650 nt4.61□□□□□ -1.67
YHP1Q04116 LDB19YOR322C 2457 nt4.6□□□□□ -1.67
YHP1Q04116 YER010CYER010C 705 nt4.6□□□□□ -1.67
YHP1Q04116 SHO1YER118C 1104 nt4.6□□□□□ -1.67
YHP1Q04116 HSP150YJL159W 1242 nt4.6□□□□□ -1.67
YHP1Q04116 PIF1YML061C 2580 nt4.6□□□□□ -1.67
YHP1Q04116 SEC12YNR026C 1416 nt4.6□□□□□ -1.67
YHP1Q04116 GLE1YDL207W 1617 nt4.59□□□□□ -1.67
YHP1Q04116 SAC6YDR129C 1929 nt4.59□□□□□ -1.67
YHP1Q04116 DFM1YDR411C 1026 nt4.59□□□□□ -1.67
YHP1Q04116 STL1YDR536W 1710 nt4.59□□□□□ -1.67
YHP1Q04116 GPA2YER020W 1350 nt4.59□□□□□ -1.67
YHP1Q04116 PRS2YER099C 957 nt4.59□□□□□ -1.67
YHP1Q04116 SFC1YJR095W 969 nt4.59□□□□□ -1.67
YHP1Q04116 ASK1YKL052C 879 nt4.59□□□□□ -1.67
YHP1Q04116 RHO2YNL090W 579 nt4.59□□□□□ -1.67
YHP1Q04116 YOR200WYOR200W 399 nt4.59□□□□□ -1.67
YHP1Q04116 YPR098CYPR098C 486 nt4.59□□□□□ -1.67
YHP1Q04116 MCM6YGL201C 3054 nt4.59□□□□□ -1.68
YHP1Q04116 RIM101YHL027W 1878 nt4.58□□□□□ -1.68
YHP1Q04116 RFA1YAR007C 1866 nt4.58□□□□□ -1.68
YHP1Q04116 GEX1YCL073C 1848 nt4.58□□□□□ -1.68
YHP1Q04116 GEX2YKR106W 1848 nt4.58□□□□□ -1.68
YHP1Q04116 MSS1YMR023C 1581 nt4.58□□□□□ -1.68
YHP1Q04116 BUL1YMR275C 2931 nt4.58□□□□□ -1.68
YHP1Q04116 DUR1,2YBR208C 5508 nt4.58□□□□□ -1.68
YHP1Q04116 UGX2YDL169C 672 nt4.58□□□□□ -1.68
YHP1Q04116 YKL223WYKL223W 333 nt4.58□□□□□ -1.68
YHP1Q04116 CWC27YPL064C 906 nt4.58□□□□□ -1.68
YHP1Q04116 YBR226CYBR226C 411 nt4.58□□□□□ -1.68
YHP1Q04116 MKK2YPL140C 1521 nt4.57□□□□□ -1.68
YHP1Q04116 CIT3YPR001W 1461 nt4.57□□□□□ -1.68
YHP1Q04116 YDL022C-AYDL022C-A 249 nt4.57□□□□□ -1.68
YHP1Q04116 VCX1YDL128W 1236 nt4.57□□□□□ -1.68
YHP1Q04116 SHP1YBL058W 1272 nt4.57□□□□□ -1.68
YHP1Q04116 PSH1YOL054W 1221 nt4.57□□□□□ -1.68
YHP1Q04116 IRS4YKR019C 1848 nt4.57□□□□□ -1.68
YHP1Q04116 COR1YBL045C 1374 nt4.56□□□□□ -1.68
YHP1Q04116 ISN1YOR155C 1353 nt4.56□□□□□ -1.68
YHP1Q04116 YME1YPR024W 2244 nt4.56□□□□□ -1.68
YHP1Q04116 YDL114WYDL114W 927 nt4.56□□□□□ -1.68
YHP1Q04116 YEA6YEL006W 1008 nt4.56□□□□□ -1.68
YHP1Q04116 YIL060WYIL060W 435 nt4.56□□□□□ -1.68
YHP1Q04116 CSG2YBR036C 1233 nt4.56□□□□□ -1.68
YHP1Q04116 YPL102CYPL102C 303 nt4.56□□□□□ -1.68
YHP1Q04116 CLP1YOR250C 1338 nt4.55□□□□□ -1.68
YHP1Q04116 RRP4YHR069C 1080 nt4.55□□□□□ -1.68
YHP1Q04116 SPO7YAL009W 780 nt4.55□□□□□ -1.68
YHP1Q04116 AAD15YOL165C 432 nt4.55□□□□□ -1.68
YHP1Q04116 BAP2YBR068C 1830 nt4.55□□□□□ -1.68
YHP1Q04116 IMA2YOL157C 1770 nt4.55□□□□□ -1.68
YHP1Q04116 LSG1YGL099W 1923 nt4.54□□□□□ -1.68
YHP1Q04116 RAT1YOR048C 3021 nt4.54□□□□□ -1.68
YHP1Q04116 PRP46YPL151C 1356 nt4.54□□□□□ -1.68
YHP1Q04116 CWC21YDR482C 408 nt4.54□□□□□ -1.68
YHP1Q04116 EGD2YHR193C 525 nt4.54□□□□□ -1.68
YHP1Q04116 SNN1YNL086W 309 nt4.54□□□□□ -1.68
YHP1Q04116 YBR124WYBR124W 360 nt4.54□□□□□ -1.68
YHP1Q04116 ATG12YBR217W 561 nt4.54□□□□□ -1.68
YHP1Q04116 HSP104YLL026W 2727 nt4.54□□□□□ -1.68
YHP1Q04116 MSN2YMR037C 2115 nt4.54□□□□□ -1.68
YHP1Q04116 SKN1YGR143W 2316 nt4.54□□□□□ -1.68
YHP1Q04116 YEL077CYEL077C 3834 nt4.53□□□□□ -1.68
YHP1Q04116 MRK1YDL079C 1506 nt4.53□□□□□ -1.68
YHP1Q04116 HOR7YMR251W-A 180 nt4.53□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 52.1 ms