Protein–RNA interactions for Protein: Q04048

SYF1, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SYF1Q04048 TIM54YJL054W 1437 nt6.84□□□□□ -1.32
SYF1Q04048 SOG2YOR353C 2376 nt6.83□□□□□ -1.32
SYF1Q04048 YJR015WYJR015W 1533 nt6.83□□□□□ -1.32
SYF1Q04048 CYC8YBR112C 2901 nt6.83□□□□□ -1.32
SYF1Q04048 APS3YJL024C 585 nt6.83□□□□□ -1.32
SYF1Q04048 YKL151CYKL151C 1014 nt6.83□□□□□ -1.32
SYF1Q04048 ATG17YLR423C 1254 nt6.83□□□□□ -1.32
SYF1Q04048 OST3YOR085W 1053 nt6.83□□□□□ -1.32
SYF1Q04048 HSX1tR(CCU)J 72 nt6.82□□□□□ -1.32
SYF1Q04048 PET112YBL080C 1626 nt6.82□□□□□ -1.32
SYF1Q04048 MKK1YOR231W 1527 nt6.81□□□□□ -1.32
SYF1Q04048 RRP45YDR280W 918 nt6.81□□□□□ -1.32
SYF1Q04048 FPR2YDR519W 408 nt6.81□□□□□ -1.32
SYF1Q04048 YGR182CYGR182C 354 nt6.81□□□□□ -1.32
SYF1Q04048 AVT4YNL101W 2142 nt6.81□□□□□ -1.32
SYF1Q04048 PRP46YPL151C 1356 nt6.81□□□□□ -1.32
SYF1Q04048 YCR097W-AYCR097W-A 267 nt6.8□□□□□ -1.32
SYF1Q04048 PRO3YER023W 861 nt6.8□□□□□ -1.32
SYF1Q04048 YGL194C-AYGL194C-A 243 nt6.8□□□□□ -1.32
SYF1Q04048 tR(ACG)JtR(ACG)J 73 nt6.8□□□□□ -1.32
SYF1Q04048 tX(XXX)DtX(XXX)D 100 nt6.8□□□□□ -1.32
SYF1Q04048 SKG1YKR100C 1068 nt6.8□□□□□ -1.32
SYF1Q04048 HXT2YMR011W 1626 nt6.79□□□□□ -1.32
SYF1Q04048 LYS12YIL094C 1116 nt6.79□□□□□ -1.32
SYF1Q04048 SFC1YJR095W 969 nt6.79□□□□□ -1.32
SYF1Q04048 CSG2YBR036C 1233 nt6.79□□□□□ -1.32
SYF1Q04048 BDF2YDL070W 1917 nt6.78□□□□□ -1.32
SYF1Q04048 PAP2YOL115W 1755 nt6.78□□□□□ -1.32
SYF1Q04048 CDC11YJR076C 1248 nt6.78□□□□□ -1.32
SYF1Q04048 DUS4YLR405W 1104 nt6.78□□□□□ -1.32
SYF1Q04048 REC114YMR133W 1287 nt6.78□□□□□ -1.32
SYF1Q04048 JIP4YDR475C 2631 nt6.78□□□□□ -1.32
SYF1Q04048 RPT6YGL048C 1218 nt6.77□□□□□ -1.33
SYF1Q04048 YJR115WYJR115W 510 nt6.77□□□□□ -1.33
SYF1Q04048 YNR040WYNR040W 771 nt6.77□□□□□ -1.33
SYF1Q04048 DAL4YIR028W 1908 nt6.77□□□□□ -1.33
SYF1Q04048 RTT106YNL206C 1368 nt6.77□□□□□ -1.33
SYF1Q04048 NOG2YNR053C 1461 nt6.77□□□□□ -1.33
SYF1Q04048 HIS7YBR248C 1659 nt6.77□□□□□ -1.33
SYF1Q04048 ECM38YLR299W 1983 nt6.77□□□□□ -1.33
SYF1Q04048 SLO1YER180C-A 258 nt6.76□□□□□ -1.33
SYF1Q04048 NPA3YJR072C 1158 nt6.76□□□□□ -1.33
SYF1Q04048 ARP3YJR065C 1350 nt6.76□□□□□ -1.33
SYF1Q04048 COX26YDR119W-A 201 nt6.75□□□□□ -1.33
SYF1Q04048 MHR1YDR296W 681 nt6.75□□□□□ -1.33
SYF1Q04048 SPT3YDR392W 1014 nt6.75□□□□□ -1.33
SYF1Q04048 YER010CYER010C 705 nt6.75□□□□□ -1.33
SYF1Q04048 YJL211CYJL211C 444 nt6.75□□□□□ -1.33
SYF1Q04048 YJU3YKL094W 942 nt6.75□□□□□ -1.33
SYF1Q04048 ARG81YML099C 2643 nt6.75□□□□□ -1.33
SYF1Q04048 YME1YPR024W 2244 nt6.74□□□□□ -1.33
SYF1Q04048 SEC20YDR498C 1152 nt6.74□□□□□ -1.33
SYF1Q04048 PIN2YOR104W 849 nt6.74□□□□□ -1.33
SYF1Q04048 GUF1YLR289W 1938 nt6.74□□□□□ -1.33
SYF1Q04048 ENP1YBR247C 1452 nt6.73□□□□□ -1.33
SYF1Q04048 NOB1YOR056C 1380 nt6.73□□□□□ -1.33
SYF1Q04048 YNL019CYNL019C 855 nt6.73□□□□□ -1.33
SYF1Q04048 YNL033WYNL033W 855 nt6.73□□□□□ -1.33
SYF1Q04048 YBL070CYBL070C 321 nt6.73□□□□□ -1.33
SYF1Q04048 MOD5YOR274W 1287 nt6.73□□□□□ -1.33
SYF1Q04048 IFA38YBR159W 1044 nt6.73□□□□□ -1.33
SYF1Q04048 PKC1YBL105C 3456 nt6.73□□□□□ -1.33
SYF1Q04048 VID30YGL227W 2877 nt6.72□□□□□ -1.33
SYF1Q04048 ATO3YDR384C 828 nt6.72□□□□□ -1.33
SYF1Q04048 CAD1YDR423C 1230 nt6.72□□□□□ -1.33
SYF1Q04048 HAP2YGL237C 798 nt6.72□□□□□ -1.33
SYF1Q04048 COS9YKL219W 1224 nt6.72□□□□□ -1.33
SYF1Q04048 TFS1YLR178C 660 nt6.72□□□□□ -1.33
SYF1Q04048 HCR1YLR192C 798 nt6.72□□□□□ -1.33
SYF1Q04048 YOR318CYOR318C 306 nt6.72□□□□□ -1.33
SYF1Q04048 YPL062WYPL062W 405 nt6.72□□□□□ -1.33
SYF1Q04048 YML082WYML082W 1950 nt6.71□□□□□ -1.33
SYF1Q04048 YDL034WYDL034W 345 nt6.71□□□□□ -1.34
SYF1Q04048 MRPL1YDR116C 858 nt6.71□□□□□ -1.34
SYF1Q04048 SUP2tY(GUA)D 75 nt6.71□□□□□ -1.34
SYF1Q04048 SUP11tY(GUA)F1 75 nt6.71□□□□□ -1.34
SYF1Q04048 SUP6tY(GUA)F2 75 nt6.71□□□□□ -1.34
SYF1Q04048 SUP7tY(GUA)J1 75 nt6.71□□□□□ -1.34
SYF1Q04048 SUP4tY(GUA)J2 75 nt6.71□□□□□ -1.34
SYF1Q04048 SUP5tY(GUA)M1 75 nt6.71□□□□□ -1.34
SYF1Q04048 SUP8tY(GUA)M2 75 nt6.71□□□□□ -1.34
SYF1Q04048 SUP3tY(GUA)O 75 nt6.71□□□□□ -1.34
SYF1Q04048 YAL056C-AYAL056C-A 351 nt6.71□□□□□ -1.34
SYF1Q04048 EFT2YDR385W 2529 nt6.71□□□□□ -1.34
SYF1Q04048 EFT1YOR133W 2529 nt6.71□□□□□ -1.34
SYF1Q04048 MSN2YMR037C 2115 nt6.7□□□□□ -1.34
SYF1Q04048 RAD3YER171W 2337 nt6.7□□□□□ -1.34
SYF1Q04048 YNR042WYNR042W 429 nt6.7□□□□□ -1.34
SYF1Q04048 YOL097W-AYOL097W-A 186 nt6.7□□□□□ -1.34
SYF1Q04048 RPN7YPR108W 1290 nt6.7□□□□□ -1.34
SYF1Q04048 RSC2YLR357W 2670 nt6.69□□□□□ -1.34
SYF1Q04048 YLL059CYLL059C 507 nt6.69□□□□□ -1.34
SYF1Q04048 YMR010WYMR010W 1218 nt6.69□□□□□ -1.34
SYF1Q04048 YOL163WYOL163W 510 nt6.69□□□□□ -1.34
SYF1Q04048 NDC1YML031W 1968 nt6.69□□□□□ -1.34
SYF1Q04048 CEF1YMR213W 1773 nt6.68□□□□□ -1.34
SYF1Q04048 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt6.68□□□□□ -1.34
SYF1Q04048 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt6.68□□□□□ -1.34
SYF1Q04048 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt6.68□□□□□ -1.34
SYF1Q04048 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 46.3 ms