Protein–RNA interactions for Protein: P78368

CSNK1G2, Casein kinase I isoform gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1G2P78368 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSNK1G2P78368 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSNK1G2P78368 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSNK1G2P78368 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSNK1G2P78368 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSNK1G2P78368 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSNK1G2P78368 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSNK1G2P78368 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSNK1G2P78368 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSNK1G2P78368 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSNK1G2P78368 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSNK1G2P78368 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSNK1G2P78368 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSNK1G2P78368 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSNK1G2P78368 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSNK1G2P78368 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSNK1G2P78368 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSNK1G2P78368 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSNK1G2P78368 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSNK1G2P78368 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSNK1G2P78368 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSNK1G2P78368 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSNK1G2P78368 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSNK1G2P78368 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSNK1G2P78368 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSNK1G2P78368 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSNK1G2P78368 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CSNK1G2P78368 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSNK1G2P78368 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSNK1G2P78368 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSNK1G2P78368 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSNK1G2P78368 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CSNK1G2P78368 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSNK1G2P78368 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSNK1G2P78368 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSNK1G2P78368 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CSNK1G2P78368 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSNK1G2P78368 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSNK1G2P78368 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CSNK1G2P78368 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSNK1G2P78368 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSNK1G2P78368 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSNK1G2P78368 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSNK1G2P78368 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CSNK1G2P78368 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSNK1G2P78368 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSNK1G2P78368 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSNK1G2P78368 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSNK1G2P78368 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSNK1G2P78368 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSNK1G2P78368 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSNK1G2P78368 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSNK1G2P78368 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSNK1G2P78368 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSNK1G2P78368 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSNK1G2P78368 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSNK1G2P78368 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSNK1G2P78368 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CSNK1G2P78368 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSNK1G2P78368 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSNK1G2P78368 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSNK1G2P78368 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSNK1G2P78368 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSNK1G2P78368 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSNK1G2P78368 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSNK1G2P78368 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSNK1G2P78368 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSNK1G2P78368 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CSNK1G2P78368 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSNK1G2P78368 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSNK1G2P78368 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSNK1G2P78368 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSNK1G2P78368 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSNK1G2P78368 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSNK1G2P78368 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSNK1G2P78368 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSNK1G2P78368 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSNK1G2P78368 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSNK1G2P78368 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSNK1G2P78368 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSNK1G2P78368 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CSNK1G2P78368 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSNK1G2P78368 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSNK1G2P78368 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
CSNK1G2P78368 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CSNK1G2P78368 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSNK1G2P78368 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSNK1G2P78368 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSNK1G2P78368 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CSNK1G2P78368 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CSNK1G2P78368 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSNK1G2P78368 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSNK1G2P78368 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSNK1G2P78368 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSNK1G2P78368 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSNK1G2P78368 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSNK1G2P78368 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSNK1G2P78368 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSNK1G2P78368 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSNK1G2P78368 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms