Protein–RNA interactions for Protein: P62995

TRA2B, Transformer-2 protein homolog beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRA2BP62995 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRA2BP62995 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRA2BP62995 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRA2BP62995 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TRA2BP62995 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRA2BP62995 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRA2BP62995 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRA2BP62995 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRA2BP62995 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRA2BP62995 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRA2BP62995 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRA2BP62995 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRA2BP62995 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRA2BP62995 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRA2BP62995 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRA2BP62995 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRA2BP62995 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRA2BP62995 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRA2BP62995 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRA2BP62995 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRA2BP62995 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRA2BP62995 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRA2BP62995 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TRA2BP62995 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRA2BP62995 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRA2BP62995 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TRA2BP62995 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRA2BP62995 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRA2BP62995 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRA2BP62995 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRA2BP62995 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRA2BP62995 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRA2BP62995 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRA2BP62995 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TRA2BP62995 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRA2BP62995 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRA2BP62995 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRA2BP62995 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRA2BP62995 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRA2BP62995 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRA2BP62995 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRA2BP62995 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRA2BP62995 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRA2BP62995 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRA2BP62995 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRA2BP62995 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRA2BP62995 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TRA2BP62995 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRA2BP62995 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRA2BP62995 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRA2BP62995 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRA2BP62995 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRA2BP62995 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRA2BP62995 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRA2BP62995 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRA2BP62995 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRA2BP62995 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRA2BP62995 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRA2BP62995 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRA2BP62995 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRA2BP62995 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRA2BP62995 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRA2BP62995 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRA2BP62995 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRA2BP62995 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRA2BP62995 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRA2BP62995 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRA2BP62995 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRA2BP62995 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRA2BP62995 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRA2BP62995 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRA2BP62995 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRA2BP62995 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRA2BP62995 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRA2BP62995 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRA2BP62995 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRA2BP62995 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRA2BP62995 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRA2BP62995 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRA2BP62995 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRA2BP62995 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRA2BP62995 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRA2BP62995 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRA2BP62995 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRA2BP62995 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRA2BP62995 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRA2BP62995 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRA2BP62995 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRA2BP62995 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRA2BP62995 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRA2BP62995 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRA2BP62995 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRA2BP62995 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TRA2BP62995 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRA2BP62995 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRA2BP62995 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TRA2BP62995 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRA2BP62995 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRA2BP62995 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRA2BP62995 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms