Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTBP60709 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTBP60709 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTBP60709 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTBP60709 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTBP60709 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTBP60709 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTBP60709 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTBP60709 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTBP60709 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTBP60709 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTBP60709 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTBP60709 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ACTBP60709 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTBP60709 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTBP60709 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTBP60709 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTBP60709 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTBP60709 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTBP60709 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTBP60709 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTBP60709 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTBP60709 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTBP60709 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTBP60709 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTBP60709 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTBP60709 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTBP60709 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTBP60709 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTBP60709 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTBP60709 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTBP60709 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTBP60709 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTBP60709 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTBP60709 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTBP60709 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTBP60709 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTBP60709 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTBP60709 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTBP60709 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTBP60709 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTBP60709 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTBP60709 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTBP60709 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTBP60709 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTBP60709 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTBP60709 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTBP60709 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTBP60709 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTBP60709 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTBP60709 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTBP60709 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTBP60709 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTBP60709 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTBP60709 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTBP60709 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTBP60709 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTBP60709 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTBP60709 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTBP60709 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTBP60709 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTBP60709 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTBP60709 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTBP60709 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTBP60709 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTBP60709 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTBP60709 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTBP60709 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
ACTBP60709 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTBP60709 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTBP60709 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTBP60709 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTBP60709 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTBP60709 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTBP60709 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTBP60709 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTBP60709 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTBP60709 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTBP60709 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTBP60709 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTBP60709 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTBP60709 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTBP60709 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTBP60709 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTBP60709 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTBP60709 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTBP60709 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTBP60709 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTBP60709 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTBP60709 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTBP60709 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTBP60709 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTBP60709 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTBP60709 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTBP60709 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTBP60709 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTBP60709 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTBP60709 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTBP60709 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTBP60709 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms