Protein–RNA interactions for Protein: P54108

CRISP3, Cysteine-rich secretory protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP3P54108 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRISP3P54108 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRISP3P54108 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRISP3P54108 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRISP3P54108 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRISP3P54108 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRISP3P54108 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRISP3P54108 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRISP3P54108 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRISP3P54108 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRISP3P54108 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRISP3P54108 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRISP3P54108 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRISP3P54108 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRISP3P54108 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRISP3P54108 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRISP3P54108 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CRISP3P54108 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRISP3P54108 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRISP3P54108 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRISP3P54108 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRISP3P54108 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRISP3P54108 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRISP3P54108 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRISP3P54108 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CRISP3P54108 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRISP3P54108 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRISP3P54108 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRISP3P54108 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRISP3P54108 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRISP3P54108 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRISP3P54108 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRISP3P54108 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRISP3P54108 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRISP3P54108 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRISP3P54108 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CRISP3P54108 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRISP3P54108 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRISP3P54108 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRISP3P54108 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRISP3P54108 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRISP3P54108 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CRISP3P54108 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CRISP3P54108 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRISP3P54108 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRISP3P54108 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRISP3P54108 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRISP3P54108 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRISP3P54108 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CRISP3P54108 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CRISP3P54108 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRISP3P54108 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRISP3P54108 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRISP3P54108 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CRISP3P54108 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRISP3P54108 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRISP3P54108 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRISP3P54108 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRISP3P54108 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRISP3P54108 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRISP3P54108 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRISP3P54108 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRISP3P54108 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRISP3P54108 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRISP3P54108 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRISP3P54108 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRISP3P54108 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRISP3P54108 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRISP3P54108 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRISP3P54108 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRISP3P54108 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRISP3P54108 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRISP3P54108 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRISP3P54108 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRISP3P54108 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRISP3P54108 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRISP3P54108 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRISP3P54108 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRISP3P54108 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRISP3P54108 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRISP3P54108 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRISP3P54108 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRISP3P54108 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRISP3P54108 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRISP3P54108 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRISP3P54108 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRISP3P54108 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRISP3P54108 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRISP3P54108 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRISP3P54108 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRISP3P54108 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRISP3P54108 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRISP3P54108 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRISP3P54108 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CRISP3P54108 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRISP3P54108 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRISP3P54108 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRISP3P54108 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRISP3P54108 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRISP3P54108 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms