Protein–RNA interactions for Protein: P53816

PLA2G16, HRAS-like suppressor 3, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLA2G16P53816 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLA2G16P53816 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLA2G16P53816 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLA2G16P53816 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLA2G16P53816 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLA2G16P53816 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLA2G16P53816 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLA2G16P53816 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLA2G16P53816 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLA2G16P53816 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLA2G16P53816 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLA2G16P53816 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PLA2G16P53816 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLA2G16P53816 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLA2G16P53816 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLA2G16P53816 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLA2G16P53816 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLA2G16P53816 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLA2G16P53816 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLA2G16P53816 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLA2G16P53816 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLA2G16P53816 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLA2G16P53816 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PLA2G16P53816 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLA2G16P53816 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PLA2G16P53816 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLA2G16P53816 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLA2G16P53816 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PLA2G16P53816 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLA2G16P53816 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLA2G16P53816 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLA2G16P53816 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLA2G16P53816 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLA2G16P53816 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLA2G16P53816 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLA2G16P53816 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLA2G16P53816 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLA2G16P53816 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLA2G16P53816 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLA2G16P53816 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLA2G16P53816 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLA2G16P53816 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLA2G16P53816 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLA2G16P53816 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PLA2G16P53816 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLA2G16P53816 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLA2G16P53816 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLA2G16P53816 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLA2G16P53816 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLA2G16P53816 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLA2G16P53816 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PLA2G16P53816 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLA2G16P53816 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLA2G16P53816 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PLA2G16P53816 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLA2G16P53816 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLA2G16P53816 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLA2G16P53816 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLA2G16P53816 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLA2G16P53816 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLA2G16P53816 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PLA2G16P53816 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLA2G16P53816 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLA2G16P53816 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLA2G16P53816 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLA2G16P53816 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLA2G16P53816 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PLA2G16P53816 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLA2G16P53816 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLA2G16P53816 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLA2G16P53816 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLA2G16P53816 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLA2G16P53816 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLA2G16P53816 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLA2G16P53816 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLA2G16P53816 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLA2G16P53816 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLA2G16P53816 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLA2G16P53816 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLA2G16P53816 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLA2G16P53816 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLA2G16P53816 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLA2G16P53816 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLA2G16P53816 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLA2G16P53816 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLA2G16P53816 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLA2G16P53816 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLA2G16P53816 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLA2G16P53816 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PLA2G16P53816 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PLA2G16P53816 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PLA2G16P53816 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLA2G16P53816 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLA2G16P53816 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PLA2G16P53816 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLA2G16P53816 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLA2G16P53816 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLA2G16P53816 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLA2G16P53816 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLA2G16P53816 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms